Python has_soma_points Beispiele

Beispiel #1

Datei: test_structural_checks.py Projekt: juanchopanza/NeuroM

    def test_has_soma_points_good_data(self):
        files = [os.path.join(SWC_PATH, f)
                 for f in ['Neuron.swc',
                           'Single_apical.swc',
                           'Single_basal.swc',
                           'Single_axon.swc']]

        files.append(os.path.join(H5V1_PATH, 'Neuron_2_branch.h5'))

        for f in files:
            nt.ok_(chk.has_soma_points(self.load_data(f)))

Beispiel #2

Datei: test_structural_checks.py Projekt: joewgraham/NeuroM

    def test_has_soma_points_good_data(self):
        files = [Path(SWC_PATH, f)
                 for f in ['Neuron.swc',
                           'Single_apical.swc',
                           'Single_basal.swc',
                           'Single_axon.swc']]

        files.append(Path(H5V1_PATH, 'Neuron_2_branch.h5'))

        for f in files:
            nt.ok_(chk.has_soma_points(self.load_data(f)))

Beispiel #3

Datei: test_structural_checks.py Projekt: juanchopanza/NeuroM

 def test_has_soma_points_bad_data(self):
     f = os.path.join(SWC_PATH, 'Single_apical_no_soma.swc')
     nt.ok_(not chk.has_soma_points(self.load_data(f)))

Beispiel #4

Datei: benchmarks.py Projekt: BlueBrain/NeuroM

 def time_has_soma_points(self):
     sc.has_soma_points(self.data_wrapper)

Beispiel #5

Datei: benchmarks.py Projekt: yamagatm/NeuroM

 def time_has_soma_points(self):
     sc.has_soma_points(self.data_wrapper)

Beispiel #6

 def test_has_soma_points_bad_data(self):
     f = Path(SWC_PATH, 'Single_apical_no_soma.swc')
     nt.ok_(not chk.has_soma_points(self.load_data(f)))