Skip to content

腰椎影像智能分割可视化系统,采用Vue+Django框架,3DUNet算法自动分割nii医疗影像文件,并且可以在前端生成分割后的部位三维建模的模型。

tshuw/Lambar_Spine_Slicer

 
 

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

9 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

Lambar_Spine_Slicer

腰椎影像智能分割可视化系统,采用Vue+Django框架,3DUNet算法自动分割nii医疗影像文件,并且可以在前端生成分割后的部位三维建模的模型。

框架

在pycharm中运行test_002文件即可

前端代码在vue_001中修改,默认8888端口

下载

下载相关依赖库

  • numpy
  • SimpleITK
  • nibabel
  • scipy
  • pytorch

训练

训练时将训练集和测试集的数据和标签文件名称存在txt文件中,dataset类中获取数据 ,在utils类中处理数据

处理操作:

  • ct影像阈值截断
  • 归一化
  • 缩小分辨率 使用dice值评估分割的准确率

config文件中设置相关参数

设置训练的模型大小,每次在输入文件中截取该大小的部分进行训练。

可以加上attention机制提高准确率

三维建模

将nii转为stl模型文件展示椎间盘,神经根,类囊膜渲染在前端

引用

https://github.com/lee-zq/3DUNet-Pytorch

About

腰椎影像智能分割可视化系统,采用Vue+Django框架,3DUNet算法自动分割nii医疗影像文件,并且可以在前端生成分割后的部位三维建模的模型。

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published

Languages

  • Python 100.0%