Ejemplos de create_legacy_kmeans_nodes en Python

Lenguaje de programación: Python

Namespace/Package Name: cellranger.analysis.clustering

Método / Función: create_legacy_kmeans_nodes

Ejemplos en hotexamples.com: 2

Python create_legacy_kmeans_nodes - 2 ejemplos encontrados. Estos son los ejemplos en Python del mundo real mejor valorados de cellranger.analysis.clustering.create_legacy_kmeans_nodes extraídos de proyectos de código abierto. Puedes valorar ejemplos para ayudarnos a mejorar la calidad de los ejemplos.

Ejemplo n.º 1

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Archivo: diffexp.py Proyecto: RagnarDanneskjold/cellranger-atac

def save_differential_expression_h5(f, clustering_key, de):
    group = f.create_group(f.root, analysis_constants.ANALYSIS_H5_DIFFERENTIAL_EXPRESSION_GROUP)

    analysis_io.save_h5(f, group, clustering_key, de)

    cr_clustering.create_legacy_kmeans_nodes(f,
                                             analysis_constants.ANALYSIS_H5_DIFFERENTIAL_EXPRESSION_GROUP,
                                             analysis_constants.ANALYSIS_H5_KMEANS_DIFFERENTIAL_EXPRESSION_GROUP,
                                             DIFFERENTIAL_EXPRESSION,
                                             clustering_key)

Ejemplo n.º 2

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Archivo: kmeans.py Proyecto: GWW/cellranger_211_mirror

def save_kmeans_h5(f, n_clusters, kmeans):
    clustering_key = cr_clustering.format_clustering_key(cr_clustering.CLUSTER_TYPE_KMEANS, n_clusters)

    group = f.create_group(f.root, cr_constants.ANALYSIS_H5_CLUSTERING_GROUP)
    cr_io.save_h5(f, group, clustering_key, kmeans)

    cr_clustering.create_legacy_kmeans_nodes(f,
                                             cr_constants.ANALYSIS_H5_CLUSTERING_GROUP,
                                             cr_constants.ANALYSIS_H5_KMEANS_GROUP,
                                             cr_clustering.CLUSTERING,
                                             clustering_key)