Ejemplos de gene_size_dict en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: random_noncoding_seq_test.py Proyecto: gturco/random_bio_tools

 def setUp(self):
     self.tab_file = '/Users/gturco/Desktop/rice_set_size.tsv'
     self.size_dict = gene_size_dict(self.tab_file)
     self.bed_file = '/Users/gturco/data/paper3/rice_b_set.nolocaldups.with_new_cns_mask.bed'

Ejemplo n.º 2

Archivo: random_noncoding_seq_test.py Proyecto: gturco/random_bio_tools

 def test_dict(self):
     size_dict = gene_size_dict(self.tab_file)
     print size_dict["Os01g02200"]
     self.assertEqual(len(size_dict["Os01g02200"]), 13)