def test_DTIFit_inputs():
input_map = dict(args=dict(argstr='%s',
),
base_name=dict(argstr='-o %s',
position=1,
usedefault=True,
),
bvals=dict(argstr='-b %s',
mandatory=True,
position=4,
),
bvecs=dict(argstr='-r %s',
mandatory=True,
position=3,
),
cni=dict(argstr='--cni=%s',
),
dwi=dict(argstr='-k %s',
mandatory=True,
position=0,
),
environ=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
gradnonlin=dict(argstr='--gradnonlin=%s',
),
ignore_exception=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
little_bit=dict(argstr='--littlebit',
),
mask=dict(argstr='-m %s',
mandatory=True,
position=2,
),
max_x=dict(argstr='-X %d',
),
max_y=dict(argstr='-Y %d',
),
max_z=dict(argstr='-Z %d',
),
min_x=dict(argstr='-x %d',
),
min_y=dict(argstr='-y %d',
),
min_z=dict(argstr='-z %d',
),
output_type=dict(),
save_tensor=dict(argstr='--save_tensor',
),
sse=dict(argstr='--sse',
),
terminal_output=dict(nohash=True,
),
)
inputs = DTIFit.input_spec()
for key, metadata in input_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
def test_DTIFit_outputs():
output_map = dict(FA=dict(),
L1=dict(),
L2=dict(),
L3=dict(),
MD=dict(),
MO=dict(),
S0=dict(),
V1=dict(),
V2=dict(),
V3=dict(),
tensor=dict(),
)
outputs = DTIFit.output_spec()
for key, metadata in output_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
def test_DTIFit_outputs():
output_map = dict(FA=dict(),
L1=dict(),
L2=dict(),
L3=dict(),
MD=dict(),
MO=dict(),
S0=dict(),
V1=dict(),
V2=dict(),
V3=dict(),
tensor=dict(),
)
outputs = DTIFit.output_spec()
for key, metadata in output_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
