初回講義の際に必要となる環境です。 以下の手順を参考にご用意ください。

• Mac

  1. R言語
  2. XQuartz

• Win

  1. R言語

1. RStudio

1. RまたはRStudioのコンソールから以下を入力してパッケージをインストール

   install.packages(‘Rcmdr’, dependencies=TRUE)

以下から環境を選択

• Docker
  • 講師と同じ環境
  • WindowsはWindows10pro以外だと設定が難しい(Docker Toolboxを試してみて問題があれば以下のAnaconda/Minicondaを使用してください)
• Anaconda/Miniconda
  • 比較的設定は容易
  • Pythonライブラリ以外の必要なものは自分でインストールする必要あり
• Google ColabやAzure Notebooks(サポート対象外)
  • タブレットからでも実行できる
  • 3Dやインタラクティブなコンテンツなど一部動かないものがある
  • デフォルトの環境にプリインストールされているもの以外は自分で導入する必要あり

1. Dockerをインストール

   • Mac
   • Windows10pro
   • Windows10pro以外

(以降、dockerが起動している状態で進める)

2. このリポジトリをクローンまたはファイルをコピーする(親ディレクトリ含め間に日本語やスペースが入らないように)

3. localhost(127.0.0.1)の8888ポートや6006ポートを使用している(他のJupyterを起動しているなど)の場合は.envのJUPYTER_PORTやTENSOR_BOARD_PORTの値を変更する

4. ターミナルからダウンロードしたフォルダに移動する(cdコマンドを使用)

5. workspace/up.shの権限を実行可能なように変更しておく

   # Mac
   chmod 777 workspace/up.sh
   # Windows
   icacls workspace\up.sh /grant Everyone:F

6. 以下のコマンドを実行する

   docker-compose build

1. Graphvizをインストール

   • Graphviz

2. Anaconda/Minicondaをインストール(まだインストールされていない場合)

   • Miniconda(Python3系)

3. 仮想環境を構築する

   • 以下のファイルの中身を1行ずつターミナル/コマンドプロンプトに貼り付けて実行
     • miniconda

4. 仮想環境に入る

   conda activate dslec

5. Jupyter notebookのコンフィグファイルを作成

   jupyter notebook --generate-config

6. カスタムCSSを配置

   • 作成されたコンフィグファイルの場所(.jupyter)の下にcustomというフォルダを作成し、その中にmy-light.cssをcustom.cssという名前でコピーする

7. Jupyter extensionsをインストールする

   • 以下のファイルの中身を1行ずつターミナル/コマンドプロンプトに貼り付けて実行
     • nbextension

8. matplotlibの日本語化

   • ネットで"matplotlib 日本語"などで検索して日本語表示できるようにしておく

1. Jupyterを起動する

   docker-compose up -d

2. Jupyterにアクセスする

   • Docker Toolboxを使っている場合は、以下のコマンドでIPアドレスを調べておき次の127.0.0.1と置き換える

     docker-machine inspect --format='{{.Driver.IPAddress}}' dev

   • ブラウザから127.0.0.1:8888にアクセスし、passwordにjupyterと入力する

3. Jupyterを終了する

   docker-compose stop

1. 仮想環境に入る

   conda activate dslec

2. Jupyterを起動する(passwordはjupyter)

   jupyter notebook

3. Jupyterを終了する

   Ctrl+C
   conda deactivate

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