Python PdbParser.parse_PDB_HYDBNDの例

コード例 #1

ファイル: test_pdbParser.py プロジェクト: 8848/Pymol-script-repo

def test_parseHYDBND_1():
    """
    """
    from MolKit.pdbParser import PdbParser
    parser = PdbParser("Data/smfx_badHYDBND.pdb")
    parser.PDBtags.remove("HYDBND")
    del parser.pdbRecordParser['HYDBND']
    parser.parse()
    failure = False
    hdbndLines = parser.getRecords(parser.allLines, "HYDBND")
    try:
        parser.parse_PDB_HYDBND(hbndLines)
    except:
        failure = True
    assert failure 

コード例 #2

ファイル: test_pdbParser.py プロジェクト: peach-eater/pymol-scripts

def test_parseHYDBND_1():
    """
    """
    from MolKit.pdbParser import PdbParser
    parser = PdbParser("Data/smfx_badHYDBND.pdb")
    parser.PDBtags.remove("HYDBND")
    del parser.pdbRecordParser['HYDBND']
    parser.parse()
    failure = False
    hdbndLines = parser.getRecords(parser.allLines, "HYDBND")
    try:
        parser.parse_PDB_HYDBND(hbndLines)
    except:
        failure = True
    assert failure