コード例 #1
0
ファイル: test_info.py プロジェクト: yimsea/seqmagick
class SimpleGzipInfoTestCase(InfoMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta.gz')
コード例 #2
0
ファイル: test_info.py プロジェクト: yimsea/seqmagick
class SimpleBzip2InfoTestCase(InfoMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta.bz2')
コード例 #3
0
ファイル: test_info.py プロジェクト: yimsea/seqmagick
class MultithreadedInfoTestCase(InfoMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta')
    threads = 2
コード例 #4
0
ファイル: test_extract_ids.py プロジェクト: yimsea/seqmagick
class GzipExtractIdsTestCase(ExtractIdsMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta.gz')
コード例 #5
0
ファイル: test_extract_ids.py プロジェクト: yimsea/seqmagick
class Bz2ExtractIdsTestCase(ExtractIdsMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta.bz2')
コード例 #6
0
ファイル: test_extract_ids.py プロジェクト: yimsea/seqmagick
class SimpleExtractIdsTestCase(ExtractIdsMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta')
コード例 #7
0
ファイル: test_mogrify.py プロジェクト: wook2014/seqmagick
class MogrifyGzipInputTestCase(CommandLineTestMixIn,
                               test_convert.GzipInputConvertTestCase):
    command = 'mogrify {input}'
    expected_path = data_path('output2.fasta')
    out_suffix = 'fasta.gz'