コード例 #1
0
 def test_partial(self):
     result = transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 4)
     self.assertEqual([self.sequences[1], self.sequences[3]], list(result))
コード例 #2
0
 def test_none_pass(self):
     result = list(transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 8))
     self.assertEqual([], result)
コード例 #3
0
 def test_all_pass(self):
     result = list(transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 0))
     self.assertEqual(self.sequences, result)
コード例 #4
0
ファイル: test_transform.py プロジェクト: yimsea/seqmagick
 def test_partial(self):
     result = transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 4)
     self.assertEqual([self.sequences[1], self.sequences[3]], list(result))
コード例 #5
0
ファイル: test_transform.py プロジェクト: yimsea/seqmagick
 def test_all_pass(self):
     result = list(transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 0))
     self.assertEqual(self.sequences, result)
コード例 #6
0
ファイル: test_transform.py プロジェクト: yimsea/seqmagick
 def test_none_pass(self):
     result = list(transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 8))
     self.assertEqual([], result)
コード例 #7
0
ファイル: test_transform.py プロジェクト: fhcrc/seqmagick
 def test_partial(self):
     result = transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 4)
     self.assertEqual(
         [self.sequences[1].seq, self.sequences[3].seq],
         [seq.seq for seq in result])
コード例 #8
0
ファイル: test_transform.py プロジェクト: peterjc/seqmagick
 def test_partial(self):
     result = transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 4)
     self.assertEqual([self.sequences[1].seq, self.sequences[3].seq],
                      [seq.seq for seq in result])