Założenia projektu:

• Ustalenie jakiej długości oraz ilu domenowe białka preferuje człowiek (Homo sapiens).
• Zestawienie danych z dwoma przykładowymi organizmami: Danio rerio oraz Saccharomyces cerevisiae

Narzędzia:

• Uniprot SwissPro
• Pfam.xfam.org
• Python: Pandas, Matplotlib, Numpy, Scipy.stats

Metodologia:

• Pobranie wszystkich danych dla białek Homo sapiens, Danio rario i Saccharomyces civisareas z bazy Uniprot.
• Utworzenie bazy danych zawierających informacje o ID białek, długościach sekwencji oraz ilości domen. -> skrypt selekcja_danych.py
• Wykonanie statystyk. hist_stat.py danio_reviewed_rozkla_g.py - skryp z wizualizacja rozkładu wartości ekstremalnej tu przykladowo dla danio
• Porównanie otrzymanych wyników z danymi z publikacji („Mathematical modeling and comparison of protein size distribution in different plant, animal, fungal and microbial species reveals a negative correlation between protein size and protein number")