def test_MedicAlgorithmLesionToads_outputs(): output_map = dict(outCortical=dict(), outFilled=dict(), outHard=dict(), outHard2=dict(), outInhomogeneity=dict(), outLesion=dict(), outMembership=dict(), outSulcal=dict(), outWM=dict(), ) outputs = MedicAlgorithmLesionToads.output_spec() for key, metadata in output_map.items(): for metakey, value in metadata.items(): yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
def test_MedicAlgorithmLesionToads_inputs(): input_map = dict(args=dict(argstr='%s', ), environ=dict(nohash=True, usedefault=True, ), ignore_exception=dict(nohash=True, usedefault=True, ), inAtlas=dict(argstr='--inAtlas %s', ), inAtlas2=dict(argstr='--inAtlas2 %s', ), inAtlas3=dict(argstr='--inAtlas3 %s', ), inAtlas4=dict(argstr='--inAtlas4 %s', ), inAtlas5=dict(argstr='--inAtlas5 %f', ), inAtlas6=dict(argstr='--inAtlas6 %s', ), inConnectivity=dict(argstr='--inConnectivity %s', ), inCorrect=dict(argstr='--inCorrect %s', ), inFLAIR=dict(argstr='--inFLAIR %s', ), inInclude=dict(argstr='--inInclude %s', ), inMaximum=dict(argstr='--inMaximum %d', ), inMaximum2=dict(argstr='--inMaximum2 %d', ), inMaximum3=dict(argstr='--inMaximum3 %d', ), inMaximum4=dict(argstr='--inMaximum4 %f', ), inMaximum5=dict(argstr='--inMaximum5 %d', ), inOutput=dict(argstr='--inOutput %s', ), inOutput2=dict(argstr='--inOutput2 %s', ), inOutput3=dict(argstr='--inOutput3 %s', ), inSmooting=dict(argstr='--inSmooting %f', ), inT1_MPRAGE=dict(argstr='--inT1_MPRAGE %s', ), inT1_SPGR=dict(argstr='--inT1_SPGR %s', ), null=dict(argstr='--null %s', ), outCortical=dict(argstr='--outCortical %s', hash_files=False, ), outFilled=dict(argstr='--outFilled %s', hash_files=False, ), outHard=dict(argstr='--outHard %s', hash_files=False, ), outHard2=dict(argstr='--outHard2 %s', hash_files=False, ), outInhomogeneity=dict(argstr='--outInhomogeneity %s', hash_files=False, ), outLesion=dict(argstr='--outLesion %s', hash_files=False, ), outMembership=dict(argstr='--outMembership %s', hash_files=False, ), outSulcal=dict(argstr='--outSulcal %s', hash_files=False, ), outWM=dict(argstr='--outWM %s', hash_files=False, ), terminal_output=dict(mandatory=True, nohash=True, ), xDefaultMem=dict(argstr='-xDefaultMem %d', ), xMaxProcess=dict(argstr='-xMaxProcess %d', usedefault=True, ), xPrefExt=dict(argstr='--xPrefExt %s', ), ) inputs = MedicAlgorithmLesionToads.input_spec() for key, metadata in input_map.items(): for metakey, value in metadata.items(): yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value