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Dyaopf/VASPy

 
 

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VASPy

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An object-oriented VASP file processing library.

Make it easier to process VASP files.

处理VASP文件从未如此 灵活 简单


VASPy 是一个纯python编写的处理VASP文件的框架

使用者可以使用VASPy的接口简单快捷的编写处理VASP文件的脚本,也可以在命令行直接操作VASP文件。

/scripts下是本人根据自己的需求,使用VASPy所写的一些脚本,可作为参考。


命令行处理DOS文件使用举例:

#处理分割好的DOS文件
>>> from vaspy.electro import DosX
>>> a = DosX('DOS1')
>>> b = DosX('DOS8')

#分波态密度合并
>>> c = a
>>> c.reset_data()              # 初始化DOS数据
>>> for i in xrange(1, 10):
>>>    c += DosX('DOS'+str(i))  # 循环合并DOS数据
>>> ...
>>> c.data                      # 以float矩阵显示合并后的数据
                                # 可直接进行计算等操作
>>> c.tofile()                  # 生成新的合并后的DOS文件

#绘图
>>> c.plotsum(0, (5, 10))       # 绘制d轨道pDOS图

绘制结果:

处理ELFCAR举例:

>>> from vaspy.electro import ElfCar
>>> a = ElfCar() 
>>> a.plot_contour()   # 绘制等值线图
>>> a.plot_mcontour()  # 使用mlab绘制等值线图(需安装Mayavi)
>>> a.plot_contour3d() # 绘制3d等值线图
>>> a.plot_field()     # 绘制标量场

绘制结果:

3D 等值线图

scalar field

charge difference(use ChgCar class)

操作XDATCAR举例

>>> from vaspy.atomco import XdatCar
>>> xdatcar = XdatCar()
>>> # 输出xdatcar相应Cartesian坐标
>>> for step, data in xdatcar:
>>>     print step
>>>     print xdatcar.dir2cart(xdatcar.bases, data)
>>> # 可直接运行script/中脚本生成相应.arc文件用于MaterialStudio显示动画
>>> python xdatcar_to_arc.py

动画实例

使用者可以编写自己的脚本来批处理VASP文件

重要更新日志

日期 版本 内容
2015-11-17 0.4.1 XdatCar类实现迭代协议
2015-10-09 0.3.0 新增InCar类
2015-10-07 0.2.12 新增Dos图颜色填充和dband center显示
2015-09-30 0.2.11 新增修改xsd文件中特定原子颜色的方法
2015-09-22 0.2.10 新增绘制TOTAL-FORCE曲线的脚本
2015-09-19 0.2.7 ELFCAR等值线绘制支持空间扩展
2015-09-17 0.2.5 新增ContCar类
2015-09-16 0.2.4 新增利用VASPy所写的生成VASP输入文件的脚本
以及由CONTAR生成xsd文件的脚本
2015-09-15 0.2.3 修复XsdFile类中数据顺序与POSCAR中顺序冲突的bug
2015-09-15 0.2.2 新增3d等值线图和标量场绘制
2015-09-13 0.2.1 新增mlab绘制contour
2015-09-13 0.2.0 新增ELFCAR图像绘制
2015-09-12 0.1.1 新增d-band center计算
2015-09-11 0.1.0 新增DosX类,处理分割后的DOS文件
2015-09-10 0.0.3 新增OutCar类,提供分析原子的受力数据
2015-08-11 0.0.2 新增XsdFile类,处理material studio的xsd文件
2015-08-04 0.0.1 初始版本, 提供的功能:
    1.处理cartisan坐标文件
    2.处理POSCAR,CONTCAR文件中的数据
    3.处理OSZICAR,处理每步迭代数据

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Processing VASP files with Python

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