Exemplos de midcountmp em Python

Exemplo n.º 1

Arquivo: test_regioncount.py Projeto: forrestzhang/bagatelle

    def testmidcountstrandmp(self):

        regioncount.midcountmp(bwfile=self.npsbw,
                               bedfile=self.strandbed,
                               up=50,
                               down=50,
                               winsize=1,
                               outfile=self.outfilest,
                               stranded=True)

Exemplo n.º 2

Arquivo: test_regioncount.py Projeto: forrestzhang/bagatelle

    def testmidcountnostrandthreadgzip(self):

        regioncount.midcountmp(bwfile=self.npsbw,
                               bedfile=self.nostrandbed,
                               up=50,
                               down=50,
                               winsize=5,
                               outfile=self.outfile,
                               threads=3)

Exemplo n.º 3

Arquivo: test_regioncount.py Projeto: forrestzhang/bagatelle

    def testmidcountstrandmp(self):

        regioncount.midcountmp(bwfile=self.npsbw, bedfile=self.strandbed, up=50, down=50,
                               winsize=1, outfile=self.outfilest, stranded=True)

Exemplo n.º 4

Arquivo: test_regioncount.py Projeto: forrestzhang/bagatelle

    def testmidcountnostrandthreadgzip(self):

        regioncount.midcountmp(bwfile=self.npsbw, bedfile=self.nostrandbed, up=50, down=50,
                               winsize=5, outfile=self.outfile, threads=3)