Exemplo n.º 1
0
 def testMFold5(self):
     self.assertEqual(hw.mfold("ACUGAGCCCUGUUAGCUAA"), 8)
Exemplo n.º 2
0
 def testMFold3(self):
     self.assertEqual(hw.mfold("AAUUGCGC"), 4)
Exemplo n.º 3
0
 def testMFold4(self):
     self.assertEqual(hw.mfold("ACUGAGCCCU"), 3)
Exemplo n.º 4
0
 def testMFold1(self):
     testRNA = "GGAUACGGCCAUACUGCGCAGAAAGCACCGCUUCCCAUCCGAACAGCGAAGUUAAGCUGCGCCAGGCGGUGUUAGUACUGGGGUGGGCGACCACCCGGGAAUCCACCGUGCCGUAUCCU"
     self.assertEqual(hw.mfold(testRNA), 52)
Exemplo n.º 5
0
 def testMFold2(self):
     self.assertEqual(hw.mfold("ACCCCCU"), 1)
Exemplo n.º 6
0
 def testMFold5(self):
     self.assertEqual(hw.mfold("ACUGAGCCCUGUUAGCUAA"), 8)
Exemplo n.º 7
0
 def testMFold4(self):
     self.assertEqual(hw.mfold("ACUGAGCCCU"), 3)
Exemplo n.º 8
0
 def testMFold3(self):
     self.assertEqual(hw.mfold("AAUUGCGC"), 4)
Exemplo n.º 9
0
 def testMFold2(self):
     self.assertEqual(hw.mfold("ACCCCCU"), 1)
Exemplo n.º 10
0
 def testMFold1(self):
     testRNA = "GGAUACGGCCAUACUGCGCAGAAAGCACCGCUUCCCAUCCGAACAGCGAAGUUAAGCUGCGCCAGGCGGUGUUAGUACUGGGGUGGGCGACCACCCGGGAAUCCACCGUGCCGUAUCCU"
     self.assertEqual(hw.mfold(testRNA), 52)