Algunas funcionalidades que pretendemos:
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PXAT hace Redes a partir de pathways.
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Anota esas redes como clasificando los nodos por sus ubicaciones en el grafo dirigido.
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Identifica trayectorias en la red
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Identifica sitios de X-talk entre pathways.
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Saca subredes a partir de pathways.
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Identificará subtrayectorias compartidas.
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Identificará el tipo de X-talk en función de los edges que lo rodean (activadores, represores, etc.)
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Integrará datos experimentales (de expresión génica)
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Identificará tipos de X-talk en función de la expresión.
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Aplicará enrichment analisis.
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Simulación basada en agentes.
Some nice visualizations we might grab: