def test_EpiReg_inputs(): input_map = dict(args=dict(argstr='%s', ), echospacing=dict(argstr='--echospacing=%f', ), environ=dict(nohash=True, usedefault=True, ), epi=dict(argstr='--epi=%s', mandatory=True, position=-4, ), fmap=dict(argstr='--fmap=%s', ), fmapmag=dict(argstr='--fmapmag=%s', ), fmapmagbrain=dict(argstr='--fmapmagbrain=%s', ), ignore_exception=dict(nohash=True, usedefault=True, ), no_clean=dict(argstr='--noclean', ), no_fmapreg=dict(argstr='--nofmapreg', ), out_base=dict(argstr='--out=%s', position=-1, usedefault=True, ), output_type=dict(), pedir=dict(argstr='--pedir=%s', ), t1_brain=dict(argstr='--t1brain=%s', mandatory=True, position=-2, ), t1_head=dict(argstr='--t1=%s', mandatory=True, position=-3, ), terminal_output=dict(nohash=True, ), weight_image=dict(argstr='--weight=%s', ), wmseg=dict(argstr='--wmseg=%s', ), ) inputs = EpiReg.input_spec() for key, metadata in input_map.items(): for metakey, value in metadata.items(): yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
def test_EpiReg_inputs(): input_map = dict( args=dict(argstr='%s', ), echospacing=dict(argstr='--echospacing=%f', ), environ=dict( nohash=True, usedefault=True, ), epi=dict( argstr='--epi=%s', mandatory=True, position=-4, ), fmap=dict(argstr='--fmap=%s', ), fmapmag=dict(argstr='--fmapmag=%s', ), fmapmagbrain=dict(argstr='--fmapmagbrain=%s', ), ignore_exception=dict( nohash=True, usedefault=True, ), no_clean=dict(argstr='--noclean', ), no_fmapreg=dict(argstr='--nofmapreg', ), out_base=dict( argstr='--out=%s', position=-1, ), output_type=dict(), pedir=dict(argstr='--pedir=%s', ), t1_brain=dict( argstr='--t1brain=%s', mandatory=True, position=-2, ), t1_head=dict( argstr='--t1=%s', mandatory=True, position=-3, ), terminal_output=dict( mandatory=True, nohash=True, ), weight_image=dict(argstr='--weight=%s', ), wmseg=dict(argstr='--wmseg=%s', ), ) inputs = EpiReg.input_spec() for key, metadata in input_map.items(): for metakey, value in metadata.items(): yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
def test_EpiReg_outputs(): output_map = dict(epi2str_inv=dict(), epi2str_mat=dict(), fmap2epi_mat=dict(), fmap2str_mat=dict(), fmap_epi=dict(), fmap_str=dict(), fmapmag_str=dict(), fullwarp=dict(), out_1vol=dict(), out_file=dict(), shiftmap=dict(), wmedge=dict(), wmseg=dict(), ) outputs = EpiReg.output_spec() for key, metadata in output_map.items(): for metakey, value in metadata.items(): yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
def test_EpiReg_outputs(): output_map = dict( epi2str_inv=dict(), epi2str_mat=dict(), fmap2epi_mat=dict(), fmap2str_mat=dict(), fmap_epi=dict(), fmap_str=dict(), fmapmag_str=dict(), fullwarp=dict(), out_1vol=dict(), out_file=dict(), shiftmap=dict(), wmedge=dict(), wmseg=dict(), ) outputs = EpiReg.output_spec() for key, metadata in output_map.items(): for metakey, value in metadata.items(): yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value