def __init__(self, nombre, dias=False, f_sueno=True, f_sedentario=True, f_ligero=True, f_moderado=True):
csv = np.genfromtxt(open(nombre, 'r'), delimiter="," , names=True)
#self.nomCols = self.csv.dtype.names
#self.nparams = len(self.nomCols)
sueno = csv['Sueño'.encode('iso8859-15')]
clasifSueno = csv['Clasificaciones_del_sueño'.encode('iso8859-15')]
flujo = csv['Flujo_térmico__media'.encode('iso8859-15')]
temp = csv['Temp_cerca_del_cuerpo__media']
tiempo = csv['Time'] / 1000
actli = csv['Ligera']
actsd = csv['Sedentaria']
actmd = csv['Moderada']
consm = csv['Gasto_energético'.encode('iso8859-15')]
acltrans = csv['Acel_transversal__picos']
self.datos_total = Datos(sueno, clasifSueno, flujo, temp, tiempo, actli, actsd, actmd, consm, acltrans)
self.selep_completo = cachitos.selEpisodio(self.datos_total, f_sueno, f_sedentario, f_ligero, f_moderado)
if(dias):
datos_dias = self.datos_total.creaDias()
self.selep_dias = []
for i in datos_dias:
self.selep_dias.append(cachitos.selEpisodio(i, f_sueno, f_sedentario, f_ligero, f_moderado))
if(DEBUG):
if(dias):
print len(datos_dias)
for i in datos_dias:
print "ini", i.tiempo[0], "fin", i.tiempo[-1]
def loadData(self):
if(DEBUG): fname = '../data.csv'
else: fname = QtGui.QFileDialog.getOpenFileName(self, 'Open file')
print "Abriendo fichero ", fname
csv = lf.LectorFichero(fname).getDatos()
selep = cachitos.selEpisodio(csv)
return selep
def __init__(self, filename=''):
self.csv = lf.LectorFichero(filename).getDatos()
selep = selEpisodio(self.csv, sedentario=False, ligero=False, moderado=False).epFiltro
self.eps_sueno= []
for i in selep:
self.eps_sueno.append(self.initEpisodio(i))
def loadData(self):
if PRUEBAS:
fname = "../data.csv"
else:
fname = QtGui.QFileDialog.getOpenFileName(self, "Open file")
print "Abriendo fichero ", fname
self.setWindowTitle("Estudio de sueños (" + fname + ")")
csv_dias = lf.LectorFichero(fname).getDatosDias()
self.epsDias = []
for i in csv_dias:
self.epsDias.append(cachitos.selEpisodio(i))
print len(self.epsDias), "dias"
self.panel = PanelConsumo(
self.epsDias,
self.layout_diario,
self.layout_dia_izq,
self.layout_dia_der,
self.cbx_izq,
self.cbx_der,
self.lbl_izq,
self.lbl_der,
)
"""
def __init__(self):
super(Main, self).__init__()
self.setupUi(self)
self.selep = cachitos.selEpisodio("../data.csv", dias=True)
self.__initCombobox__()
self.drawActividadesPie()
self.drawConsumosPie()
self.drawRatioBar()
def loadData(self):
if(PRUEBAS): fname = '../data.csv'
else: fname = QtGui.QFileDialog.getOpenFileName(self, 'Open file')
print "Abriendo fichero ", fname
csv = lf.LectorFichero(fname).getDatos()
self.selep = cachitos.selEpisodio(csv, sedentario=False, ligero=False, moderado=False)
self.setWindowTitle('Estudio de sueños (' + fname +')')
self.initTabs()
def loadData(self):
if PRUEBAS:
fname = "../data.csv"
else:
fname = QtGui.QFileDialog.getOpenFileName(self, "Open file")
print "Abriendo fichero ", fname
self.csv = lf.LectorFichero(fname)
self.selep = cachitos.selEpisodio(self.csv.getDatos(), sedentario=False, ligero=False, moderado=False)
self.setWindowTitle("Estudio de sueños (" + fname + ")")
self.initTabs()
def loadData(self):
def updateUI():
print "Actualizando interfaz"
#idx = int(self.cbx1.currentText()[5])
#idx = self.getCbxIdx()
idx = self.cbx1.currentIndex()
self.plotGraph(self.fig1_var1, self.selep.epFiltro[idx].tiempo, self.selep.epFiltro[idx].temp, temperatura=True)
self.plotGraph(self.fig1_var2, self.selep.epFiltro[idx].tiempo, self.selep.epFiltro[idx].flujo, flujo=True)
self.plotGraph(self.fig2_var1, self.selep.epFiltro[idx].tiempo, self.selep.epFiltro[idx].temp, temperatura=True)
self.plotGraph(self.fig2_var2, self.selep.epFiltro[idx].tiempo, self.selep.epFiltro[idx].flujo, flujo=True)
if(DEBUG): fname = '../data.csv'
else: fname = QtGui.QFileDialog.getOpenFileName(self, 'Open file')
print "Abriendo fichero ", fname
self.selep = cachitos.selEpisodio(fname, sedentario=False, ligero=False, moderado=False)
self.configureComboBox()
updateUI()
def initTabs(self):
self.tabs = []
self.tabs.append(
PanelSueno(
self.selep,
self.plotLayoutUp,
self.plotLayoutBot,
self.cbx1,
self.cbx2,
self.rbTemperatura,
self.rbConsumo,
self.lbl1,
self.lbl2,
self.tableLayout,
self.dendrogramLayout,
)
)
sel2 = copy(self.selep)
sel2.update(sNocturno=False, sedentario=False, ligero=False, moderado=False)
# self.selep.update(sNocturno=False, sedentario=False, ligero=False, moderado=False)
self.tabs.append(
PanelSueno(
sel2,
self.plotLayoutUpSiestas,
self.plotLayoutBotSiestas,
self.cbx1Siestas,
self.cbx2Siestas,
self.rbTemperaturaSiestas,
self.rbConsumoSiestas,
self.lbl1Siestas,
self.lbl2Siestas,
self.tableLayoutSiestas,
self.dendrogramLayoutSiestas,
)
)
# self.selep.update(sDiurno=False, sedentario=False, ligero=False, moderado=False)
sel3 = copy(self.selep)
sel3.update(sDiurno=False, sedentario=False, ligero=False, moderado=False)
self.tabs.append(
PanelSueno(
sel3,
self.plotLayoutUpSuenos,
self.plotLayoutBotSuenos,
self.cbx1Suenos,
self.cbx2Suenos,
self.rbTemperaturaSuenos,
self.rbConsumoSuenos,
self.lbl1Suenos,
self.lbl2Suenos,
self.tableLayoutSuenos,
self.dendrogramLayoutSuenos,
)
)
epsDias = []
for i in self.csv.getDatosDias():
epsDias.append(cachitos.selEpisodio(i))
self.tabs.append(
PanelConsumo(
epsDias,
self.layout_diario,
self.layout_dia_izq,
self.layout_dia_der,
self.cbx_izq,
self.cbx_der,
self.lbl_izq,
self.lbl_der,
)
)
from sklearn import preprocessing
from scipy.spatial.distance import euclidean
from fastdtw import fastdtw
import scipy.spatial.distance as ssd
import math
import mlpy
#Representa un episodio de sueño mediante las series temporales de flujo y temperatura
class Individuo:
def __init__(self, tiempo, temperatura, flujo):
self.tiempo = tiempo
self.stt = temperatura
self.stf = flujo
#Cargar datos y filtrar por episodios de sueño
sel = cachitos.selEpisodio("../data.csv")
sel.filSueno = True
sel.filSedentario = False
sel.filLigero = False
sel.filModerado = False
sel.update()
print "Normalizar", len(sel.epFiltro), "episodios de sueño"
# Normalizar por estandarización cada episodio de sueño (temperatura y flujo)
eps_sueno = []
for i in sel.epFiltro:
a = preprocessing.scale(i.temp, copy=False)
b = preprocessing.scale(i.flujo, copy=False)
eps_sueno.append(Individuo(i.tiempo, a, b))
def loadData(self):
fname = QtGui.QFileDialog.getOpenFileName(self, 'Open file')
print "Abriendo fichero ", fname
selep = cachitos.selEpisodio(fname)
return selep
