Python cmdExists Beispiele

Beispiel #1

 def testLAcat(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('LAcat'))

Beispiel #2

 def testDBsplit(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('DBsplit'))

Beispiel #3

 def testDBdust(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('DBdust'))

Beispiel #4

 def testBLASTDATABASE(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('makeblastdb'))

Beispiel #5

 def testF2DB(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('fasta2DB'))

Beispiel #6

Datei: test.py Projekt: EvdH0/poreFUME

 def testBLASTN(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('blastn'))

Beispiel #7

 def testBLASTN(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('blastn'))

Beispiel #8

Datei: test.py Projekt: EvdH0/poreFUME

 def testSamtools(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('samtools'))

Beispiel #9

Datei: test.py Projekt: EvdH0/poreFUME

 def testParallel(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('parallel'))

Beispiel #10

Datei: test.py Projekt: EvdH0/poreFUME

 def testDBdust(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('DBdust'))

Beispiel #11

Datei: test.py Projekt: EvdH0/poreFUME

 def testLAcat(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('LAcat'))

Beispiel #12

Datei: test.py Projekt: EvdH0/poreFUME

 def testDBsplit(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('DBsplit'))  

Beispiel #13

Datei: test.py Projekt: EvdH0/poreFUME

 def testF2DB(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('fasta2DB'))    

Beispiel #14

Datei: test.py Projekt: EvdH0/poreFUME

 def testBLASTDATABASE(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('makeblastdb'))

Beispiel #15

 def testSamtools(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('samtools'))

Beispiel #16

 def testPOA(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('poa'))

Beispiel #17

 def testParallel(self):
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('parallel'))

Beispiel #18

Datei: test.py Projekt: EvdH0/poreFUME

 def testPOA(self): 
     self.assertTrue(poreFUME.cmdExists('poa'))