Ejemplos de SMCScoring.validate2A en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: gentruth.py Proyecto: Sage-Bionetworks/SMC-Het-Challenge

def getTruth2B(yml_ob,truth_vcf_prefix,vcf_location,filename=''):
	data = getTruth2A(yml_ob,truth_vcf_prefix,vcf_location)
	ccm = SMCScoring.validate2A(data,data.count('\n')+1)
	if filename:
		np.savetxt(filename,ccm)
	return ccm

Ejemplo n.º 2

Archivo: gentruth.py Proyecto: asalcedo31/SMC-Het_Scoring

def getTruth2B(yml_ob, truth_vcf_prefix, vcf_location, filename=''):
    data = getTruth2A(yml_ob, truth_vcf_prefix, vcf_location)
    ccm = SMCScoring.validate2A(data, data.count('\n') + 1)
    if filename:
        np.savetxt(filename, ccm)
    return ccm