Ejemplos de Polypeptide.three_to_index en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: polinteraction.py Proyecto: ibraheem-moosa/protein-bvalue-nonseq

def aa_to_index(aa):
    """
    :param aa: Three character amino acid name.
    :returns: Integer index as per BioPython, unknown/non-standard amino acids return 20.
    """
    if Polypeptide.is_aa(aa, standard=True):
        return Polypeptide.three_to_index(aa)
    else:
        return 20

Ejemplo n.º 2

Archivo: torch_nn.py Proyecto: ibraheem-moosa/protein-bvalue-prediction

def aa_to_index(aa):
    if Polypeptide.is_aa(aa, standard=True):
        return Polypeptide.three_to_index(aa)
    else:
        return 20