Ejemplos de PipelineIDR.getIDRPlotStatement en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: pipeline_idr.py Proyecto: jmadzo/cgat

def plotBatchConsistencyForPooledPseudoreplicates(infiles, outfile):
    idr_script = os.path.join(os.path.dirname(P.__file__), "WrapperIDR.py")
    statement = IDR.getIDRPlotStatement(infiles[0], outfile, idr_script)
    P.run()

Ejemplo n.º 2

def plotBatchConsistencyForPooledPseudoreplicates(infiles, outfile):
    idr_script = os.path.join(os.path.dirname(P.__file__), "WrapperIDR.py")
    statement = IDR.getIDRPlotStatement(infiles[0], outfile, idr_script)
    P.run()

Ejemplo n.º 3

Archivo: pipeline_idr.py Proyecto: jmadzo/cgat

def plotBatchConsistencyForIndividualReplicates(infiles, outfile):
    # HACK!
    idr_script = os.path.join(os.path.dirname(P.__file__), "WrapperIDR.py")
    statement = IDR.getIDRPlotStatement(infiles, outfile, idr_script)
    P.run()

Ejemplo n.º 4

def plotBatchConsistencyForIndividualReplicates(infiles, outfile):
    # HACK!
    idr_script = os.path.join(os.path.dirname(P.__file__), "WrapperIDR.py")
    statement = IDR.getIDRPlotStatement(infiles, outfile, idr_script)
    P.run()

Ejemplo n.º 5

def plotBatchConsistencyForPooledPseudoreplicates(infiles, outfile):
    statement = IDR.getIDRPlotStatement(infiles[0], outfile)
    P.run()

Ejemplo n.º 6

def plotBatchConsistencyForIndividualReplicates(infiles, outfile):

    # HACK!
    statement = IDR.getIDRPlotStatement(infiles, outfile)
    P.run()

Ejemplo n.º 7

Archivo: pipeline_idr.py Proyecto: CGATOxford/CGATPipelines

def plotBatchConsistencyForPooledPseudoreplicates(infiles, outfile):
    statement = IDR.getIDRPlotStatement(infiles[0], outfile)
    P.run()

Ejemplo n.º 8

Archivo: pipeline_idr.py Proyecto: CGATOxford/CGATPipelines

def plotBatchConsistencyForIndividualReplicates(infiles, outfile):

    # HACK!
    statement = IDR.getIDRPlotStatement(infiles, outfile)
    P.run()