Ejemplos de BehaviorOphysSession._get_roi_masks_by_cell_roi_id en Python

Ejemplo n.º 1

def test_get_roi_masks_by_cell_roi_id(roi_ids, expected,
                                      cell_specimen_table_api):
    ssn = BehaviorOphysSession(api=cell_specimen_table_api)
    obtained = ssn._get_roi_masks_by_cell_roi_id(roi_ids)
    assert np.allclose(expected, obtained.values)
    assert np.allclose(obtained.coords['row'], [0.5, 1.5, 2.5, 3.5, 4.5])
    assert np.allclose(obtained.coords['column'],
                       [0.25, 0.75, 1.25, 1.75, 2.25])

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_behavior_ophys_session.py Proyecto: yarikoptic/AllenSDK

def test_get_roi_masks_by_cell_roi_id(roi_ids, expected, cell_specimen_table_api):
    ssn = BehaviorOphysSession(api=cell_specimen_table_api)
    obtained = ssn._get_roi_masks_by_cell_roi_id(roi_ids)
    assert np.allclose(expected, obtained.values)