Ejemplos de midcount en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_regioncount.py Proyecto: forrestzhang/bagatelle

    def testmidcountnostrand(self):

        regioncount.midcount(bwfile=self.npsbw,
                             bedfile=self.nostrandbed,
                             up=50,
                             down=50,
                             winsize=5,
                             outfile=self.outfilenth1)

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_regioncount.py Proyecto: forrestzhang/bagatelle

    def testmidcountstrand(self):

        regioncount.midcount(bwfile=self.npsbw,
                             bedfile=self.strandbed,
                             up=50,
                             down=50,
                             winsize=5,
                             outfile=self.outfilest,
                             stranded=True)

Ejemplo n.º 3

Archivo: test_regioncount.py Proyecto: forrestzhang/bagatelle

    def testmidcountstrand(self):

        regioncount.midcount(bwfile=self.npsbw, bedfile=self.strandbed, up=50, down=50,
                             winsize=5, outfile=self.outfilest, stranded=True)

Ejemplo n.º 4

Archivo: test_regioncount.py Proyecto: forrestzhang/bagatelle

    def testmidcountnostrand(self):

        regioncount.midcount(bwfile=self.npsbw, bedfile=self.nostrandbed, up=50, down=50,
                             winsize=5, outfile=self.outfilenth1)