Ejemplos de PipelineRrbs.runBiSeq en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: pipeline_rrbs.py Proyecto: microbialman/cgat-flow

def runBiSeq_germline(infiles, outfile):
    job_options = "-l mem_free=10G -pe dedicated 10"
    RRBS.runBiSeq(infiles,
                  outfile,
                  "Germline",
                  submit=True,
                  job_options=job_options)

Ejemplo n.º 2

Archivo: pipeline_rrbs.py Proyecto: microbialman/cgat-flow

def runBiSeq_liver(infiles, outfile):
    job_options = "-l mem_free=10G -pe dedicated 10"
    RRBS.runBiSeq(infiles,
                  outfile,
                  "Liver",
                  submit=True,
                  job_options=job_options)