Ejemplos de parse_read_data en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_binary_sff.py Proyecto: miklou/pycogent

    def test_write_read_data(self):
        write_read_data(self.output_file, READ_DATA)

        file_pos = self.output_file.tell()
        self.assertTrue(file_pos % 8 == 0)

        self.output_file.seek(0)
        num_flows = len(READ_DATA['flowgram_values'])
        num_bases = len(READ_DATA['Bases'])
        observed = parse_read_data(self.output_file, num_bases, num_flows)
        self.assertEqual(observed, READ_DATA)

        file_pos = self.output_file.tell()
        self.assertTrue(file_pos % 8 == 0)

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_binary_sff.py Proyecto: mikerobeson/pycogent

    def test_write_read_data(self):
        write_read_data(self.output_file, READ_DATA)

        file_pos = self.output_file.tell()
        self.assertTrue(file_pos % 8 == 0)

        self.output_file.seek(0)
        num_flows = len(READ_DATA['flowgram_values'])
        num_bases = len(READ_DATA['Bases'])
        observed = parse_read_data(self.output_file, num_bases, num_flows)
        self.assertEqual(observed, READ_DATA)

        file_pos = self.output_file.tell()
        self.assertTrue(file_pos % 8 == 0)

Ejemplo n.º 3

Archivo: test_binary_sff.py Proyecto: miklou/pycogent

 def test_parse_read_data(self):
     self.sff_file.seek(440 + 32)
     observed = parse_read_data(self.sff_file, 271, 400)
     self.assertEqual(observed, READ_DATA)

Ejemplo n.º 4

Archivo: test_binary_sff.py Proyecto: mikerobeson/pycogent

 def test_parse_read_data(self):
     self.sff_file.seek(440 + 32)
     observed = parse_read_data(self.sff_file, 271, 400)
     self.assertEqual(observed, READ_DATA)