Ejemplos de molecule_to_mol2 en Python

Lenguaje de programación: Python

Namespace/Package Name: gaff2xml.utils

Método / Función: molecule_to_mol2

Ejemplos en hotexamples.com: 2

Python molecule_to_mol2 - 2 ejemplos encontrados. Estos son los ejemplos en Python del mundo real mejor valorados de gaff2xml.utils.molecule_to_mol2 extraídos de proyectos de código abierto. Puedes valorar ejemplos para ayudarnos a mejorar la calidad de los ejemplos.

Ejemplo n.º 1

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Archivo: test_drugs.py Proyecto: pgrinaway/gaff2xml

def test_drugs():
    database_filename = utils.get_data_filename("chemicals/drugs/Zdd.mol2.gz")
    ifs = openeye.oechem.oemolistream(database_filename)
    for molecule in ifs.GetOEGraphMols():
        with utils.enter_temp_directory():
            molecule_name, tripos_mol2_filename = utils.molecule_to_mol2(molecule)
            yield lambda : utils.test_molecule(molecule_name, tripos_mol2_filename)  # Cute trick to iteratively run this test over entire database.

Ejemplo n.º 2

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Archivo: test_drugs.py Proyecto: ChayaSt/gaff2xml

def test_drugs():
    import openeye.oechem
    database_filename = utils.get_data_filename("chemicals/drugs/Zdd.mol2.gz")
    ifs = openeye.oechem.oemolistream(database_filename)
    for molecule in ifs.GetOEGraphMols():
        with utils.enter_temp_directory():
            molecule_name, tripos_mol2_filename = utils.molecule_to_mol2(molecule)
            yield utils.tag_description(lambda : utils.test_molecule(molecule_name, tripos_mol2_filename), "Testing drugs %s" % molecule_name)