Ejemplos de SequenceRange.get_intersection en Python

Lenguaje de programación: Python

Namespace/Package Name: hommod.models.range

Clase / Tipo: SequenceRange

Método / Función: get_intersection

Ejemplos en hotexamples.com: 3

Python SequenceRange.get_intersection - 3 ejemplos encontrados. Estos son los ejemplos en Python del mundo real mejor valorados de hommod.models.range.SequenceRange.get_intersection extraídos de proyectos de código abierto. Puedes valorar ejemplos para ayudarnos a mejorar la calidad de los ejemplos.

Métodos usados con frecuencia

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SequenceRange(30)

get_intersection(2)

overlaps_with(2)

ac(1)

encloses(1)

get_distance_from(1)

get_length(1)

get_percentage_overlap(1)

get_sub_sequence(1)

includes_residue(1)

is_left_from(1)

is_right_from(1)

merge_with(1)

Ejemplo n.º 1

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Archivo: test_range.py Proyecto: cmbi/hommod-rest

def test_intersection():

    r1 = SequenceRange(1, 15, "AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA")
    r2 = SequenceRange(10, 20, "AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA")

    i = r1.get_intersection(r2)

    eq_(i.start, 10)
    eq_(i.end, 15)

Ejemplo n.º 2

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Archivo: test_range.py Proyecto: cmbi/hommod

def test_intersection():

    r1 = SequenceRange(1, 15, "AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA")
    r2 = SequenceRange(10, 20,
                       "AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA")

    i = r1.get_intersection(r2)

    eq_(i.start, 10)
    eq_(i.end, 15)

Ejemplo n.º 3

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Archivo: test_range.py Proyecto: cmbi/hommod

def test_no_intersection():
    r1 = SequenceRange(1, 15, "AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA")
    r2 = SequenceRange(15, 30,
                       "AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA")

    i = r1.get_intersection(r2)