Ejemplos de undersample_per_chr en Python

Lenguaje de programación: Python

Namespace/Package Name: iced.utils._genome

Método / Función: undersample_per_chr

Ejemplos en hotexamples.com: 2

Python undersample_per_chr - 2 ejemplos encontrados. Estos son los ejemplos en Python del mundo real mejor valorados de iced.utils._genome.undersample_per_chr extraídos de proyectos de código abierto. Puedes valorar ejemplos para ayudarnos a mejorar la calidad de los ejemplos.

Ejemplo n.º 1

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Archivo: test_genome.py Proyecto: NelleV/iced

def test_undersample_per_chr():
    X = np.array([[1, 1, 0, 0], [1, 1, 0, 0], [0, 0, 0.5, 0.5],
                  [0, 0, 0.5, 0.5]])
    lengths = np.array([2, 2])
    undersampled_X = undersample_per_chr(X, lengths)
    undersampled_X_true = np.array([[1, 0], [0, 0.5]])
    assert_array_equal(undersampled_X_true, undersampled_X)

Ejemplo n.º 2

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Archivo: test_genome.py Proyecto: IkutoJyu/HiC-Pro

def test_undersample_per_chr():
    X = np.array([[1, 1, 0, 0],
                  [1, 1, 0, 0],
                  [0, 0, 0.5, 0.5],
                  [0, 0, 0.5, 0.5]])
    lengths = np.array([2, 2])
    undersampled_X = undersample_per_chr(X, lengths, resolution=1)
    undersampled_X_true = np.array([[1, 0],
                                    [0, 0.5]])
    assert_array_equal(undersampled_X_true, undersampled_X)