Ejemplo n.º 1
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject)
Ejemplo n.º 2
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'preparation', 'unwarping', 'denoising', 'preprocessing', 'parcellation',  'registration')
     self.reportName = self.config.get('qa','report_name')
     self.imgWidth = 650
     self.debug = False
Ejemplo n.º 3
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'preprocessing', 'preparation', 'unwarping', 'masking')
Ejemplo n.º 4
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'preparation')
Ejemplo n.º 5
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'hardi', 'masking')
Ejemplo n.º 6
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'hardi', 'registration' ,'masking')
Ejemplo n.º 7
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'tensors', 'masking')
Ejemplo n.º 8
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'denoising', 'preparation',
                          'unwarping')
Ejemplo n.º 9
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'preparation')
     self.id = subject.getConfig().get('parcellation', 'id')
Ejemplo n.º 10
0
    def __init__(self, subject):
        """Fits a diffusion tensor model at each voxel

        """
        GenericTask.__init__(self, subject, 'preprocessing', 'preparation', 'unwarping', 'masking')
Ejemplo n.º 11
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'tensors', 'masking', 'unwarping',
                          'preprocessing', 'preparation', 'registration')
Ejemplo n.º 12
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'preparation')
     self.id = subject.getConfig().get('parcellation', 'id')
Ejemplo n.º 13
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, "preparation", "parcellation")
Ejemplo n.º 14
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'preprocessing', 'parcellation', 'preparation')
Ejemplo n.º 15
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'denoising', 'preparation', 'unwarping')
Ejemplo n.º 16
0
 def __init__(self, subject):
     self.subjectDir = subject.getDir()
     GenericTask.__init__(self, subject)
     self.setCleanupBeforeImplement(False)
Ejemplo n.º 17
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'registration')
Ejemplo n.º 18
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'preprocessing', 'parcellation',
                          'preparation')
Ejemplo n.º 19
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'backup')
Ejemplo n.º 20
0
    def __init__(self, subject):
        """Fits a diffusion tensor model at each voxel

        """
        GenericTask.__init__(self, subject, 'preprocessing', 'preparation',
                             'unwarping', 'masking')
Ejemplo n.º 21
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject)
Ejemplo n.º 22
0
 def __init__(self, subject):
     GenericTask.__init__(self, subject, 'registration')