Ejemplos de MorphologyImporter.fromSWCFile en Python

Lenguaje de programación: Python

Namespace/Package Name: morphforge.morphology.importer.morphologyimporter

Clase / Tipo: MorphologyImporter

Método / Función: fromSWCFile

Ejemplos en hotexamples.com: 2

Python MorphologyImporter.fromSWCFile - 2 ejemplos encontrados. Estos son los ejemplos en Python del mundo real mejor valorados de morphforge.morphology.importer.morphologyimporter.MorphologyImporter.fromSWCFile extraídos de proyectos de código abierto. Puedes valorar ejemplos para ayudarnos a mejorar la calidad de los ejemplos.

Métodos usados con frecuencia

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fromSWCFile(1)

Métodos usados con frecuencia

fromSWCFile (1)

Ejemplo n.º 1

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Archivo: morpharraytest.py Proyecto: NeuroArchive/morphforge

from morphforge.morphology.core.morphologyarray import MorphologyArray

from morphforge.morphology.core.morphologytree import MorphologyTree
from morphforge.morphology.ui.mayavirenderer import MayaViRenderer
from morphforge.morphology.ui.matplotlibviewer import MatPlotLibViewer
from morphforge.morphology.importer.morphologyimporter import MorphologyImporter
from morphforge.morphology.exporter.morphologyexporter import MorphologyExporter
from morphforge.morphology.comparison.comparearrays import MorphArrayComparison
from morphforge.morphology.builders.morphologyloader import MorphologyLoader






m = MorphologyImporter.fromSWCFile(filename="/home/michael/workspace/morphforge/src/test_data/swc_srcs/28o_spindle20aFI.CNG.swc", astype=MorphologyTree)


MorphologyExporter.toSWCFile(morphology = m, filename="/home/michael/Desktop/test1.swc")

m2 = MorphologyImporter.fromSWCFile(filename="/home/michael/Desktop/test1.swc", astype=MorphologyTree)



#m2 = MorphologyLoader.fromSWC(src=open("/home/michael/workspace/morphforge/src/test_data/swc_srcs/28o_spindle20aFI.CNG.swc"))

Ejemplo n.º 2

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# (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE
#  OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
# ----------------------------------------------------------------------

from morphforge.morphology.core.morphologyarray import MorphologyArray

from morphforge.morphology.core.morphologytree import MorphologyTree
from morphforge.morphology.ui.mayavirenderer import MayaViRenderer
from morphforge.morphology.ui.matplotlibviewer import MatPlotLibViewer
from morphforge.morphology.importer.morphologyimporter import MorphologyImporter
from morphforge.morphology.exporter.morphologyexporter import MorphologyExporter
from morphforge.morphology.comparison.comparearrays import MorphArrayComparison
from morphforge.morphology.builders.morphologyloader import MorphologyLoader

m = MorphologyImporter.fromSWCFile(
    filename=
    "/home/michael/workspace/morphforge/src/test_data/swc_srcs/28o_spindle20aFI.CNG.swc",
    astype=MorphologyTree)

MorphologyExporter.toSWCFile(morphology=m,
                             filename="/home/michael/Desktop/test1.swc")

m2 = MorphologyImporter.fromSWCFile(filename="/home/michael/Desktop/test1.swc",
                                    astype=MorphologyTree)

#m2 = MorphologyLoader.fromSWC(src=open("/home/michael/workspace/morphforge/src/test_data/swc_srcs/28o_spindle20aFI.CNG.swc"))

are_same = MorphArrayComparison.are_same(m, m2)
print are_same

#m = MorphologyLoader2.loadSWCFile(filename="/home/michael/workspace/morphforge/src/test_data/swc_srcs/05b_pyramidal9aACC.CNG_short.swc", astype=MorphologyTree)