Ejemplos de DerSimonianLaird en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_meta_ibma.py Proyecto: nicholst/NiMARE

def test_DerSimonianLaird(testdata_ibma):
    """
    Smoke test for DerSimonianLaird.
    """
    meta = ibma.DerSimonianLaird()
    res = meta.fit(testdata_ibma)
    assert isinstance(meta.results, nimare.results.MetaResult)
    assert isinstance(res, nimare.results.MetaResult)

Ejemplo n.º 2

Archivo: plot_ibma.py Proyecto: koudyk/NiMARE

              cmap='RdBu_r')

###############################################################################
# Weighted Least Squares
# -----------------------------------------------------------------------------
meta = ibma.WeightedLeastSquares(tau2=0)
meta.fit(dset)
plot_stat_map(meta.results.get_map('z'),
              cut_coords=[0, 0, -8],
              draw_cross=False,
              cmap='RdBu_r')

###############################################################################
# DerSimonian-Laird
# -----------------------------------------------------------------------------
meta = ibma.DerSimonianLaird()
meta.fit(dset)
plot_stat_map(meta.results.get_map('z'),
              cut_coords=[0, 0, -8],
              draw_cross=False,
              cmap='RdBu_r')

###############################################################################
# Hedges
# -----------------------------------------------------------------------------
meta = ibma.Hedges()
meta.fit(dset)
plot_stat_map(meta.results.get_map('z'),
              cut_coords=[0, 0, -8],
              draw_cross=False,
              cmap='RdBu_r')

Ejemplo n.º 3

Archivo: plot_ibma.py Proyecto: NBCLab/NiMARE

)

###############################################################################
# Weighted Least Squares
# -----------------------------------------------------------------------------
meta = ibma.WeightedLeastSquares(tau2=0, resample=True)
meta.fit(dset)
plot_stat_map(meta.results.get_map("z"),
              cut_coords=[0, 0, -8],
              draw_cross=False,
              cmap="RdBu_r")

###############################################################################
# DerSimonian-Laird
# -----------------------------------------------------------------------------
meta = ibma.DerSimonianLaird(resample=True)
meta.fit(dset)
plot_stat_map(meta.results.get_map("z"),
              cut_coords=[0, 0, -8],
              draw_cross=False,
              cmap="RdBu_r")

###############################################################################
# Hedges
# -----------------------------------------------------------------------------
meta = ibma.Hedges(resample=True)
meta.fit(dset)
plot_stat_map(meta.results.get_map("z"),
              cut_coords=[0, 0, -8],
              draw_cross=False,
              cmap="RdBu_r")