Ejemplo n.º 1
0
 def test_alignment_length(self, cigar_str, expected):
     cigar_units = cigar.parse_cigar_string(cigar_str)
     self.assertEqual(cigar.alignment_length(cigar_units), expected)
Ejemplo n.º 2
0
 def test_parse_cigar_string_three_pieces(self, cigar_str, expected):
     self.assertEqual(cigar.parse_cigar_string(cigar_str), expected)
Ejemplo n.º 3
0
 def test_parse_cigar_string_detects_bad_inputs(self, bad_cigar_str):
     with self.assertRaises(ValueError):
         cigar.parse_cigar_string(bad_cigar_str)
Ejemplo n.º 4
0
 def test_parse_cigar_string_single(self, cigar_str, expected):
     self.assertEqual(cigar.parse_cigar_string(cigar_str), expected)