def get_common_extend(self, trees):
"""Wspolne rozszerzenie bedace suma wszystkich klastrow dla wszystkich drzew"""
return find_consensus_tree(trees, 0)
prunedTree = pruneTree(dendropy.Tree(tree), leaves)
if prunedTree:
draw.drawTree(prunedTree)
print("\n\n")
# tree.print_plot()
for break_tree_index in range(len(break_trees)):
if break_tree_index+1 < len(break_trees):
distance = break_trees[break_tree_index].get_rf_distance(break_trees[break_tree_index+1])
print(str(distance))
try:
# Znajdowanie drzewa konsensusu o podanym procencie zgodności
consensus_tree = consensus_tree_file.find_consensus_tree(trees, percent)
print("Consensus tree \n\n")
#Wypisywanie drzewa konsensusu
draw.drawTree(consensus_tree)
except Exception as error:
# Jezeli wyjatek -> rodzina klastrow niezgodna dla drzewa konsensusu
print(str(error))
try:
# Znajdowanie wspolnego rozszerzenia
common_extend = CommonExtend().get_common_extend(trees)
#Wypisywanie wspolnego rozszerzenia
print('\n\n')
print('Wspolne rozszerzenie: \n\n')
draw.drawTree(common_extend)
except Exception as error:
