Ejemplos de getReactionRatesEx en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: rrTester.py Proyecto: pablo-mayrgundter/roadrunner

def checkGetReactionRatesEx(testId):
    print string.ljust("Check " + testId, rpadding),
    errorFlag = False
    inputConcs = asarray(readLine().split(), dtype=float64)
    values = rrPython.getReactionRatesEx(inputConcs)
    outputRates = asarray(readLine().split(), dtype=float64)
    if not allclose(values, outputRates):
        errorFlag = True
    print passMsg(errorFlag)

Ejemplo n.º 2

Archivo: rrTester.py Proyecto: TotteKarlsson/roadrunner

def checkGetReactionRatesEx (testId):
  print string.ljust ("Check " + testId, rpadding),
  errorFlag = False
  inputConcs = asarray (readLine().split(), dtype=float64)
  values = rrPython.getReactionRatesEx (inputConcs)
  outputRates = asarray (readLine().split(), dtype=float64)
  if not allclose (values, outputRates):
    errorFlag = True
  print passMsg (errorFlag)

Ejemplo n.º 3

import rrPython
import os
import csv

os.chdir("C:\\RoadRunner\\bin")

function = "getReactionRatesEx"
rrPython.loadSBMLFromFile("C:\\RoadRunner\\Models\\feedback.xml")
rrPython.simulate()

SpeciesArray = [1.0, 0.9, 0.8, 0.6]

try:
    rates = rrPython.getReactionRatesEx(SpeciesArray)
    if str(rates) is not False:
        result = "True"
    else:
        result = "False"
except:
    result = "False"


PythonTestResults = open("C:\\RoadRunner\\PythonTestResults.csv", "a")
writer = csv.writer(PythonTestResults)
writevar = function + "=" + result
writer.writerow([writevar])
PythonTestResults.close()

Ejemplo n.º 4

Archivo: getReactionRatesEx.py Proyecto: JulianoGianlupi/CompuCell3D-NanoHub

import rrPython
import os
import csv
os.chdir('C:\\RoadRunner\\bin')

function = 'getReactionRatesEx'
rrPython.loadSBMLFromFile('C:\\RoadRunner\\Models\\feedback.xml')
rrPython.simulate()

SpeciesArray = [1.0, .9, .8, .6]

try:
    rates = rrPython.getReactionRatesEx(SpeciesArray)
    if str(rates) is not False:
        result = 'True'
    else:
        result = 'False'
except:
    result = 'False'

PythonTestResults = open('C:\\RoadRunner\\PythonTestResults.csv', 'a')
writer = csv.writer(PythonTestResults)
writevar = function + '=' + result
writer.writerow([writevar])
PythonTestResults.close()