Ejemplo n.º 1
0
    def _choose_ligand_frame(self):
        choose_ligand_labelframe = LabelFrame(self.root, text="选择配体")
        choose_ligand_labelframe.place(x=10, y=10, width=570, height=50)

        choose_ligands = SButton(root=choose_ligand_labelframe,
                                 text="选择单/多个配体",
                                 x=10,
                                 y=0)
        create_tooltip(choose_ligands.button, "选择单/多个配体,配体格式必须是pdbqt!")
        choose_ligand_dir = SButton(root=choose_ligand_labelframe,
                                    text="选择文件夹",
                                    x=110,
                                    y=0)
        create_tooltip(choose_ligand_dir.button, "选择包含pdbqt格式配体的文件夹。")
        self.choose_ligand_entry = SEntry(
            root=choose_ligand_labelframe,
            textvariable=StringVar(),
            text=Configer.get_para("choose_docking_ligands"),
            x=200,
            y=4,
            width=360)
        create_tooltip(self.choose_ligand_entry.entry, "选择的配体或者包含配体的文件夹")
        choose_ligands.bind_open_files(
            entry_text=self.choose_ligand_entry.textvariable,
            title="选择单/多个配体",
            file_type="pdbqt")
        choose_ligand_dir.bind_open_dir(
            entry_text=self.choose_ligand_entry.textvariable,
            title="选择包含pdbqt配体的文件夹")
Ejemplo n.º 2
0
    def _choose_ligand_frame(self):
        choose_ligand_labelframe = LabelFrame(self.root, text="选择/提取配体")
        choose_ligand_labelframe.place(x=10, y=10, width=570, height=120)

        # 选择输入配体的格式
        SLabel(root=choose_ligand_labelframe, text="输入格式:",
               x=10, y=0)
        input_format_text = ("pdbqt", "sdf", "pdb")
        self.input_format = SCombbox(root=choose_ligand_labelframe, textvariable=StringVar(),
                                     values=input_format_text,
                                     default_value=Configer.get_para("complex_ligand_format"),
                                     x=80, y=0, width=60)
        create_tooltip(self.input_format.combobox, "导入配体的格式")

        # 选择第几个配体
        SLabel(root=choose_ligand_labelframe, text="选择第",
               x=160, y=0)
        self.complex_ligand_num_entry = SEntry(choose_ligand_labelframe, textvariable=StringVar(),
                                               text=Configer.get_para("complex_ligand_num"),
                                               x=205, y=2, width=20)
        create_tooltip(self.complex_ligand_num_entry.entry, "只针对多构象pdbqt文件。输入"
                                                            "要进行复合或者提取的构象。"
                                                            "如果为0则全部提取/复合")
        SLabel(root=choose_ligand_labelframe, text="个构象",
               x=230, y=0)

        # 选择配体
        choose_ligands_button = SButton(choose_ligand_labelframe, text="选择单/多个配体", x=10, y=30)
        create_tooltip(choose_ligands_button.button, "选择一个或者多个所选格式的配体")
        choose_ligand_dir_button = SButton(choose_ligand_labelframe, text="选择文件夹", x=110, y=30)
        create_tooltip(choose_ligand_dir_button.button, "选择包含配体的文件夹,匹配其中所选格式的文件")
        self.choose_ligands_entry = SEntry(root=choose_ligand_labelframe, textvariable=StringVar(),
                                           text=Configer.get_para("choose_complex_ligands"),
                                           x=200, y=34, width=360)
        create_tooltip(self.choose_ligands_entry.entry, "所选的配体或者包含配体的目录")
        choose_ligands_button.bind_open_files(entry_text=self.choose_ligands_entry.textvariable,
                                              title="选择单/多个配体",
                                              file_type=self.input_format.textvariable)
        choose_ligand_dir_button.bind_open_dir(entry_text=self.choose_ligands_entry.textvariable,
                                               title="选择包含配体文件的文件夹")

        # 选择单独输出配体文件夹
        choose_output_button = SButton(choose_ligand_labelframe, text="提取配体输出路径", x=10, y=65)
        create_tooltip(choose_output_button.button, "单独提取配体,选择要输出的文件夹。")
        self.extract_output_entry = SEntry(choose_ligand_labelframe,
                                           textvariable=StringVar(),
                                           text=Configer.get_para("extract_pdbqt_dir"),
                                           x=120, y=65 + 3, width=340)
        create_tooltip(self.extract_output_entry.entry, "输出的文件夹")
        choose_output_button.bind_open_dir(entry_text=self.extract_output_entry.textvariable,
                                           title="选择提取配体输出的文件夹")
        extract_button = SButton(choose_ligand_labelframe, text="提取选定的配体",
                                 x=470, y=65)
        extract_button.button.bind("<Button-1>", self.extract)
        create_tooltip(extract_button.button, "提取配体")
Ejemplo n.º 3
0
    def _create_choose_ligand_frame(self):
        choose_ligand_labelframe = LabelFrame(self.root, text="输入选项")
        choose_ligand_labelframe.place(x=10, y=10, width=570, height=85)

        # 选择输入配体的格式
        SLabel(root=choose_ligand_labelframe, text="输入格式:", x=10, y=0)
        input_format_text = ("mol", "sdf", "mol2", "pdb", "pdbqt", "xyz")
        self.input_format = SCombbox(
            root=choose_ligand_labelframe,
            textvariable=StringVar(),
            values=input_format_text,
            default_value=Configer.get_para("input_format"),
            x=80,
            y=0,
            width=60)
        create_tooltip(self.input_format.combobox, "导入配体的格式")

        choose_ligands_button = SButton(choose_ligand_labelframe,
                                        text="选择单/多个配体",
                                        x=10,
                                        y=30)
        create_tooltip(choose_ligands_button.button, "选择一个或者多个所选格式的配体")
        choose_ligand_dir_button = SButton(choose_ligand_labelframe,
                                           text="选择文件夹",
                                           x=110,
                                           y=30)
        create_tooltip(choose_ligand_dir_button.button,
                       "选择包含配体的文件夹,匹配其中所选格式的文件")
        self.choose_ligands_entry = SEntry(
            root=choose_ligand_labelframe,
            textvariable=StringVar(),
            text=Configer.get_para("choose_ligands"),
            x=200,
            y=34,
            width=360)
        create_tooltip(self.choose_ligands_entry.entry, "所选的配体或者包含配体的目录")
        choose_ligands_button.bind_open_files(
            entry_text=self.choose_ligands_entry.textvariable,
            title="选择单/多个配体",
            file_type=self.input_format.textvariable)
        choose_ligand_dir_button.bind_open_dir(
            entry_text=self.choose_ligands_entry.textvariable,
            title="选择包含配体文件的文件夹")