Ejemplos de multi_step_rg_engine en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: pregxs_tools.py Proyecto: ssongna/sastbx_module_sastbx

def get_inputs(args):
    data = args[0]
    d_max = float(args[1])
    if (len(args) > 2):
        rg = float(args[2])
    else:
        rg = 0
    prior = None
    data = saxs_read_write.read_standard_ascii_qis(data)
    if (rg == 0):
        msga = guinier_analyses.multi_step_rg_engine(data)
        rg = msga.median_rg

    m = 1.0 / data.i[0]
    data.multiply_add(m, 0.0)
    n_params = 10
    n_fst_pass = 4

    #  fitter = fixed_dmax_fitter(prior, data, d_max, n_params, n_fst_pass, n_trial=4, n_simplex=10)
    #  fitter.best_fit.show_pr( open("best.pr",'w') )
    #  fitter.best_fit.show_obs_vs_calc( open("best.qii",'w') )

    delta = rg
    step = 2
    d_max_scan = dmax_scan(prior,
                           data,
                           d_max,
                           delta,
                           step,
                           rg,
                           n_params,
                           n_fst_pass,
                           n_trial=1,
                           n_simplex=10)
    d_max_scan.get_best_dmax()

Ejemplo n.º 2

Archivo: search_pdb.py Proyecto: ssongna/sastbx_module_sastbx

def get_rg(data, out=None):
    global stdfile
    out = stdfile
    msga = guinier_analyses.multi_step_rg_engine(data, out)
    return msga.median_rg, msga.median_io

Ejemplo n.º 3

Archivo: search_pdb.py Proyecto: ssongna/sastbx_module_sastbx

 def get_rg(self, data, out=None):
     out = self.file
     msga = guinier_analyses.multi_step_rg_engine(data, out)
     return msga.median_rg, msga.median_io

Ejemplo n.º 4

def get_rg(data, out=None):
    msga = guinier_analyses.multi_step_rg_engine(data, out)
    return msga.median_rg