Ejemplos de parse_cigar_string en Python

Ejemplo n.º 1

 def test_parse_cigar_string_detects_bad_inputs(self, bad_cigar_str):
     with self.assertRaises(ValueError):
         cigar.parse_cigar_string(bad_cigar_str)

Ejemplo n.º 2

 def test_parse_cigar_string_single(self, cigar_str, expected):
     self.assertEqual(cigar.parse_cigar_string(cigar_str), expected)

Ejemplo n.º 3

 def test_parse_cigar_string_three_pieces(self, cigar_str, expected):
     self.assertEqual(cigar.parse_cigar_string(cigar_str), expected)

Ejemplo n.º 4

 def test_alignment_length(self, cigar_str, expected):
     cigar_units = cigar.parse_cigar_string(cigar_str)
     self.assertEqual(cigar.alignment_length(cigar_units), expected)

Ejemplo n.º 5

Archivo: cigar_test.py Proyecto: kong75/deepvariant

 def test_parse_cigar_string_detects_bad_inputs(self, bad_cigar_str):
   with self.assertRaises(ValueError):
     cigar.parse_cigar_string(bad_cigar_str)

Ejemplo n.º 6

Archivo: cigar_test.py Proyecto: kong75/deepvariant

 def test_parse_cigar_string_three_pieces(self, cigar_str, expected):
   self.assertEqual(cigar.parse_cigar_string(cigar_str), expected)

Ejemplo n.º 7

Archivo: cigar_test.py Proyecto: kong75/deepvariant

 def test_parse_cigar_string_single(self, cigar_str, expected):
   self.assertEqual(cigar.parse_cigar_string(cigar_str), expected)

Ejemplo n.º 8

Archivo: cigar_test.py Proyecto: kong75/deepvariant

 def test_alignment_length(self, cigar_str, expected):
   cigar_units = cigar.parse_cigar_string(cigar_str)
   self.assertEqual(cigar.alignment_length(cigar_units), expected)