Ejemplos de seq_slicer en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_vcf_to_fasta.py Proyecto: johnchase/wilder_lab

    def test_seq_slicer2(self):     
        actual = fp2
        input = (90466134, 90466314)
        expected = 'AAAGATGATATTTACTTCTCTCATCTCATTCTTGTTTCAAGACCTGTTAGTCATAAGGGCTTTGTGTGGAAAATTACATATGCATGAGTATTTCATAACCAAATGGTTGTAATCTCTTCTACTCATCTGGTTCCACAGTAGGAAGTCAAAAAACTGTGTATTCGTCATTTCATGGTTGATT'

        self.assertEqual(seq_slicer(actual, input), expected)

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_vcf_to_fasta.py Proyecto: johnchase/wilder_lab

 def test_seq_slicer(self):     
     actual = fp
     input = (16050151, 16050251)
     expected = 'TTATTGATCTTTTGTGACATGCACGTGGGTTCCCAGTAGCAAGAAACTAAAGGGTCGCAGGCCGGTTTCTGCTAATTTCTTTAATTCCAAGACAGTCTCAA'
     self.assertEqual(seq_slicer(actual, input ), expected)