def test_add_duplicate_chrom_with_replace(smpl_fasta):
if 'added' not in smpl_fasta:
chrom = lp.Chromosome('added', 'U' * 100)
smpl_fasta.add_chrom(chrom)
chrom = lp.Chromosome('added', 'U' * 200)
smpl_fasta.add_chrom(chrom, replace=True)
assert len(smpl_fasta['added']) == 200
smpl_fasta.del_chrom('added')
def test_remove_Chromosome(smpl_fasta):
if 'added' not in smpl_fasta:
chrom = lp.Chromosome('added', 'U' * 100)
smpl_fasta.add_chrom(chrom)
chrom = smpl_fasta['added']
smpl_fasta.del_chrom(chrom)
assert 'added' not in smpl_fasta
def test_add_duplicate_chrom(smpl_fasta):
chrom = lp.Chromosome('added', 'U' * 100)
if 'added' not in smpl_fasta:
smpl_fasta.add_chrom(chrom)
with pytest.raises(ValueError):
smpl_fasta.add_chrom(chrom)
smpl_fasta.del_chrom('added')
def test_add_chrom(smpl_fasta):
chrom = lp.Chromosome('added', 'U' * 100)
smpl_fasta.add_chrom(chrom)
assert len(smpl_fasta['added']) == 100
smpl_fasta.del_chrom('added')