Python i_segment_length Examples

Example #1

File: test_morphtree.py Project: wvangeit/NeuroM

def test_segment_lengths():

    T = NEURON_TREE

    lg = [l for l in i_segment_length(T)]

    nt.assert_equal(lg, [1.0, 1.0, 2.0, 1.0, 2.0, 1.0, 1.0, 2.0, 1.0, 1.0])

Example #2

File: test_neuron.py Project: wvangeit/NeuroM

    def test_get_segment_lengths(self):
        ref_seglen = []
        for t in self.neuron.neurites:
            ref_seglen.extend(ll for ll in i_segment_length(t))

        seglen = self.neuron.get_segment_lengths()
        nt.assert_equal(len(seglen), 840)
        nt.assert_true(np.all(seglen == ref_seglen))

        seglen = self.neuron.get_segment_lengths(TreeType.all)
        nt.assert_equal(len(seglen), 840)
        nt.assert_true(np.all(seglen == ref_seglen))

Example #3

File: test_neuron.py Project: wvangeit/NeuroM

    def test_get_segment_lengths(self):
        ref_seglen = []
        for t in self.neuron.neurites:
            ref_seglen.extend(ll for ll in i_segment_length(t))

        seglen = self.neuron.get_segment_lengths()
        nt.assert_equal(len(seglen), 840)
        nt.assert_true(np.all(seglen == ref_seglen))

        seglen = self.neuron.get_segment_lengths(TreeType.all)
        nt.assert_equal(len(seglen), 840)
        nt.assert_true(np.all(seglen == ref_seglen))