Python pick_channels_cov Exemples

Exemple #1

Fichier : test_cov.py Projet : emanuele/mne-python

def test_io_cov():
    """Test IO for noise covariance matrices
    """
    cov = read_cov(cov_fname)
    cov.save(op.join(tempdir, 'cov.fif'))
    cov2 = read_cov(op.join(tempdir, 'cov.fif'))
    assert_array_almost_equal(cov.data, cov2.data)

    cov2 = read_cov(cov_gz_fname)
    assert_array_almost_equal(cov.data, cov2.data)
    cov2.save(op.join(tempdir, 'cov.fif.gz'))
    cov2 = read_cov(op.join(tempdir, 'cov.fif.gz'))
    assert_array_almost_equal(cov.data, cov2.data)

    cov['bads'] = ['EEG 039']
    cov_sel = pick_channels_cov(cov, exclude=cov['bads'])
    assert_true(cov_sel['dim'] == (len(cov['data']) - len(cov['bads'])))
    assert_true(cov_sel['data'].shape == (cov_sel['dim'], cov_sel['dim']))
    cov_sel.save(op.join(tempdir, 'cov.fif'))

    cov2 = read_cov(cov_gz_fname)
    assert_array_almost_equal(cov.data, cov2.data)
    cov2.save(op.join(tempdir, 'cov.fif.gz'))
    cov2 = read_cov(op.join(tempdir, 'cov.fif.gz'))
    assert_array_almost_equal(cov.data, cov2.data)

Exemple #2

Fichier : test_cov.py Projet : jaidevd/mne-python

def test_io_cov():
    """Test IO for noise covariance matrices
    """
    cov = read_cov(cov_fname)
    cov.save(op.join(tempdir, 'cov.fif'))
    cov2 = read_cov(op.join(tempdir, 'cov.fif'))
    assert_array_almost_equal(cov.data, cov2.data)

    cov2 = read_cov(cov_gz_fname)
    assert_array_almost_equal(cov.data, cov2.data)
    cov2.save(op.join(tempdir, 'cov.fif.gz'))
    cov2 = read_cov(op.join(tempdir, 'cov.fif.gz'))
    assert_array_almost_equal(cov.data, cov2.data)

    cov['bads'] = ['EEG 039']
    cov_sel = pick_channels_cov(cov, exclude=cov['bads'])
    assert_true(cov_sel['dim'] == (len(cov['data']) - len(cov['bads'])))
    assert_true(cov_sel['data'].shape == (cov_sel['dim'], cov_sel['dim']))
    cov_sel.save(op.join(tempdir, 'cov.fif'))

    cov2 = read_cov(cov_gz_fname)
    assert_array_almost_equal(cov.data, cov2.data)
    cov2.save(op.join(tempdir, 'cov.fif.gz'))
    cov2 = read_cov(op.join(tempdir, 'cov.fif.gz'))
    assert_array_almost_equal(cov.data, cov2.data)