def test_BEDPOSTX4_outputs(): output_map = dict(bpx_out_directory=dict(), dyads=dict(), mean_fsamples=dict(), mean_phsamples=dict(), mean_thsamples=dict(), merged_fsamples=dict(), merged_phsamples=dict(), merged_thsamples=dict(), xfms_directory=dict(), ) outputs = BEDPOSTX4.output_spec() for key, metadata in output_map.items(): for metakey, value in metadata.items(): yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
def test_BEDPOSTX4_inputs(): input_map = dict(all_ard=dict(argstr='--allard', xor=('no_ard', 'all_ard'), ), args=dict(argstr='%s', ), bpx_directory=dict(argstr='%s', usedefault=True, ), burn_in=dict(argstr='--burnin=%d', ), burn_in_no_ard=dict(argstr='--burninnoard=%d', ), burn_period=dict(argstr='-b %d', ), bvals=dict(mandatory=True, ), bvecs=dict(mandatory=True, ), dwi=dict(mandatory=True, ), environ=dict(nohash=True, usedefault=True, ), fibres=dict(argstr='-n %d', ), force_dir=dict(argstr='--forcedir', usedefault=True, ), fudge=dict(argstr='--fudge=%d', ), gradnonlin=dict(argstr='--gradnonlin=%s', ), ignore_exception=dict(nohash=True, usedefault=True, ), jumps=dict(argstr='-j %d', ), logdir=dict(argstr='--logdir=%s', usedefault=True, ), mask=dict(mandatory=True, ), model=dict(argstr='-model %d', ), n_fibres=dict(argstr='--nfibres=%d', ), n_jumps=dict(argstr='--njumps=%d', ), nlgradient=dict(argstr='-g', ), no_ard=dict(argstr='--noard', xor=('no_ard', 'all_ard'), ), no_cuda=dict(argstr='-c', ), no_spat=dict(argstr='--nospat', xor=('no_spat', 'non_linear'), ), non_linear=dict(argstr='--nonlinear', xor=('no_spat', 'non_linear'), ), output_type=dict(), sample_every=dict(argstr='--sampleevery=%d', ), sampling=dict(argstr='-s %d', ), seed=dict(argstr='--seed=%d', ), terminal_output=dict(nohash=True, ), update_proposal_every=dict(argstr='--updateproposalevery=%d', ), weight=dict(argstr='-w %.2f', ), ) inputs = BEDPOSTX4.input_spec() for key, metadata in input_map.items(): for metakey, value in metadata.items(): yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
def test_BEDPOSTX4_inputs(): input_map = dict( all_ard=dict( argstr='--allard', xor=('no_ard', 'all_ard'), ), args=dict(argstr='%s', ), bpx_directory=dict( argstr='%s', usedefault=True, ), burn_in=dict(argstr='--burnin=%d', ), burn_in_no_ard=dict(argstr='--burninnoard=%d', ), burn_period=dict(argstr='-b %d', ), bvals=dict(mandatory=True, ), bvecs=dict(mandatory=True, ), dwi=dict(mandatory=True, ), environ=dict( nohash=True, usedefault=True, ), fibres=dict(argstr='-n %d', ), force_dir=dict( argstr='--forcedir', usedefault=True, ), fudge=dict(argstr='--fudge=%d', ), gradnonlin=dict(argstr='--gradnonlin=%s', ), ignore_exception=dict( nohash=True, usedefault=True, ), jumps=dict(argstr='-j %d', ), logdir=dict( argstr='--logdir=%s', usedefault=True, ), mask=dict(mandatory=True, ), model=dict(argstr='-model %d', ), n_fibres=dict(argstr='--nfibres=%d', ), n_jumps=dict(argstr='--njumps=%d', ), nlgradient=dict(argstr='-g', ), no_ard=dict( argstr='--noard', xor=('no_ard', 'all_ard'), ), no_cuda=dict(argstr='-c', ), no_spat=dict( argstr='--nospat', xor=('no_spat', 'non_linear'), ), non_linear=dict( argstr='--nonlinear', xor=('no_spat', 'non_linear'), ), output_type=dict(), sample_every=dict(argstr='--sampleevery=%d', ), sampling=dict(argstr='-s %d', ), seed=dict(argstr='--seed=%d', ), terminal_output=dict(nohash=True, ), update_proposal_every=dict(argstr='--updateproposalevery=%d', ), weight=dict(argstr='-w %.2f', ), ) inputs = BEDPOSTX4.input_spec() for key, metadata in input_map.items(): for metakey, value in metadata.items(): yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value