def test_JistBrainMgdmSegmentation_inputs():
input_map = dict(
args=dict(argstr='%s', ),
environ=dict(
nohash=True,
usedefault=True,
),
ignore_exception=dict(
nohash=True,
usedefault=True,
),
inAdjust=dict(argstr='--inAdjust %s', ),
inAtlas=dict(argstr='--inAtlas %s', ),
inCompute=dict(argstr='--inCompute %s', ),
inCurvature=dict(argstr='--inCurvature %f', ),
inData=dict(argstr='--inData %f', ),
inFLAIR=dict(argstr='--inFLAIR %s', ),
inMP2RAGE=dict(argstr='--inMP2RAGE %s', ),
inMP2RAGE2=dict(argstr='--inMP2RAGE2 %s', ),
inMPRAGE=dict(argstr='--inMPRAGE %s', ),
inMax=dict(argstr='--inMax %d', ),
inMin=dict(argstr='--inMin %f', ),
inOutput=dict(argstr='--inOutput %s', ),
inPV=dict(argstr='--inPV %s', ),
inPosterior=dict(argstr='--inPosterior %f', ),
inSteps=dict(argstr='--inSteps %d', ),
inTopology=dict(argstr='--inTopology %s', ),
null=dict(argstr='--null %s', ),
outLevelset=dict(
argstr='--outLevelset %s',
hash_files=False,
),
outPosterior2=dict(
argstr='--outPosterior2 %s',
hash_files=False,
),
outPosterior3=dict(
argstr='--outPosterior3 %s',
hash_files=False,
),
outSegmented=dict(
argstr='--outSegmented %s',
hash_files=False,
),
terminal_output=dict(nohash=True, ),
xDefaultMem=dict(argstr='-xDefaultMem %d', ),
xMaxProcess=dict(
argstr='-xMaxProcess %d',
usedefault=True,
),
xPrefExt=dict(argstr='--xPrefExt %s', ),
)
inputs = JistBrainMgdmSegmentation.input_spec()
for key, metadata in input_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
def test_JistBrainMgdmSegmentation_outputs():
output_map = dict(outLevelset=dict(),
outPosterior2=dict(),
outPosterior3=dict(),
outSegmented=dict(),
)
outputs = JistBrainMgdmSegmentation.output_spec()
for key, metadata in output_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
def test_JistBrainMgdmSegmentation_inputs():
input_map = dict(args=dict(argstr='%s',
),
environ=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
ignore_exception=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
inAdjust=dict(argstr='--inAdjust %s',
),
inAtlas=dict(argstr='--inAtlas %s',
),
inCompute=dict(argstr='--inCompute %s',
),
inCurvature=dict(argstr='--inCurvature %f',
),
inData=dict(argstr='--inData %f',
),
inFLAIR=dict(argstr='--inFLAIR %s',
),
inMP2RAGE=dict(argstr='--inMP2RAGE %s',
),
inMP2RAGE2=dict(argstr='--inMP2RAGE2 %s',
),
inMPRAGE=dict(argstr='--inMPRAGE %s',
),
inMax=dict(argstr='--inMax %d',
),
inMin=dict(argstr='--inMin %f',
),
inOutput=dict(argstr='--inOutput %s',
),
inPV=dict(argstr='--inPV %s',
),
inPosterior=dict(argstr='--inPosterior %f',
),
inSteps=dict(argstr='--inSteps %d',
),
inTopology=dict(argstr='--inTopology %s',
),
null=dict(argstr='--null %s',
),
outLevelset=dict(argstr='--outLevelset %s',
hash_files=False,
),
outPosterior2=dict(argstr='--outPosterior2 %s',
hash_files=False,
),
outPosterior3=dict(argstr='--outPosterior3 %s',
hash_files=False,
),
outSegmented=dict(argstr='--outSegmented %s',
hash_files=False,
),
terminal_output=dict(mandatory=True,
nohash=True,
),
xDefaultMem=dict(argstr='-xDefaultMem %d',
),
xMaxProcess=dict(argstr='-xMaxProcess %d',
usedefault=True,
),
xPrefExt=dict(argstr='--xPrefExt %s',
),
)
inputs = JistBrainMgdmSegmentation.input_spec()
for key, metadata in input_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
