Python toPairData Exemples

Exemple #1

Fichier : sdfloader.py Projet : tjod/obchord

def obprop(imol, mol):
 for p in mol.GetData():
  if openbabel.toPairData(p).GetDataType() == openbabel.PairData:
    if p.GetAttribute() == 'OpenBabel Symmetry Classes':
      pass
    else:
      print str(imol) + "\t" + p.GetAttribute() + "\t" +  p.GetValue()

Exemple #2

def obprop(imol, mol):
    for p in mol.GetData():
        if openbabel.toPairData(p).GetDataType() == openbabel.PairData:
            if p.GetAttribute() == 'OpenBabel Symmetry Classes':
                pass
            else:
                print str(imol) + "\t" + p.GetAttribute() + "\t" + p.GetValue()

Exemple #3

Fichier : pybel_py2.x.py Projet : baoilleach/obstereo-2-2-x

 def __setitem__(self, key, value):
     if key in self:
         pairdata = ob.toPairData(self._mol.GetData(key))
         pairdata.SetValue(str(value))
     else:
         pairdata = ob.OBPairData()
         pairdata.SetAttribute(key)
         pairdata.SetValue(str(value))
         self._mol.CloneData(pairdata)

Exemple #4

Fichier : pybel_py3x.py Projet : luolingqi/fragmap_2

 def __setitem__(self, key, value):
     if key in self:
         pairdata = ob.toPairData(self._mol.GetData(key))
         pairdata.SetValue(str(value))
     else:
         pairdata = ob.OBPairData()
         pairdata.SetAttribute(key)
         pairdata.SetValue(str(value))
         self._mol.CloneData(pairdata)

Exemple #5

Fichier : pybel.py Projet : candycode/openbabel

 def __setitem__(self, key, value):
     if key in self:
         pairdata = ob.toPairData(self._mol.GetData(key))
         pairdata.SetValue(str(value))
     else:
         pairdata = ob.OBPairData()
         pairdata.SetAttribute(key)
         pairdata.SetValue(str(value))
         pairdata.thisown = 0 # So that SWIG Proxy will not delete pairdata
         self._mol.SetData(pairdata)

Exemple #6

 def __setitem__(self, key, value):
     if key in self:
         pairdata = ob.toPairData(self._mol.GetData(key))
         pairdata.SetValue(str(value))
     else:
         pairdata = ob.OBPairData()
         pairdata.SetAttribute(key)
         pairdata.SetValue(str(value))
         pairdata.thisown = 0  # So that SWIG Proxy will not delete pairdata
         self._mol.SetData(pairdata)

Exemple #7

Fichier : pybel_py2.x.py Projet : baoilleach/obstereo-2-2-x

 def __getitem__(self, key):
     self._testforkey(key)
     return ob.toPairData(self._mol.GetData(key)).GetValue()

Exemple #8

Fichier : pybel_py2.x.py Projet : baoilleach/obstereo-2-2-x

 def _data(self):
     return [ob.toPairData(x) for x in self._mol.GetData() if x.GetDataType()==ob.PairData or x.GetDataType()==ob.CommentData]

Exemple #9

Fichier : pybel_py3x.py Projet : luolingqi/fragmap_2

 def __getitem__(self, key):
     self._testforkey(key)
     return ob.toPairData(self._mol.GetData(key)).GetValue()

Exemple #10

Fichier : pybel_py3x.py Projet : luolingqi/fragmap_2

 def _data(self):
     return [ob.toPairData(x) for x in self._mol.GetData() if x.GetDataType()==ob.PairData or x.GetDataType()==ob.CommentData]

Exemple #11

Fichier : obmol.py Projet : tjod/umdb

	def insert_bondproperties(self, obmol):
		"""loop over bonds' properties and insert them"""
		for bond in ob.OBMolBondIter(obmol):
			for p in bond.GetData():
				if ob.toPairData(p).GetDataType() == ob.PairData:
					self.db.insert_bondproperty(bond.GetBeginAtomIdx(), bond.GetEndAtomIdx(), p.GetAttribute(), p.GetValue())