def run_predict_cv(self) -> None:
        """クロスバリデーションで学習した各foldのモデルの平均により、テストデータの予測を行う
        あらかじめrun_train_cvを実行しておく必要がある
        """
        logger.info(f'{self.run_name} - start prediction cv')

        test_x = RunnerLeaveOneOut.load_x_test(self.features)

        preds = []

        # 各foldのモデルで予測を行う
        for i_fold in range(self.n_fold):
            logger.info(f'{self.run_name} - start prediction fold:{i_fold}')
            model = self.build_model(i_fold)
            model.load_model(self.features)
            pred = model.predict(test_x)
            preds.append(pred)
            logger.info(f'{self.run_name} - end prediction fold:{i_fold}')

        # 予測の平均値を出力する
        pred_avg = np.mean(preds, axis=0)

        # 予測結果の保存
        Util.dump(pred_avg, f'../model/pred/{self.run_name}-test.pkl')

        logger.info(f'{self.run_name} - end prediction cv')
Exemple #2
0
 def save_model(self, feature):
     model_path = os.path.join(f'../model/model/{feature}',
                               f'{self.run_fold_name}.h5')
     scaler_path = os.path.join(f'../model/model/{feature}',
                                f'{self.run_fold_name}-scaler.pkl')
     os.makedirs(os.path.dirname(model_path), exist_ok=True)
     self.model.save(model_path)
     Util.dump(self.scaler, scaler_path)
    def run_train_cv(self, lr_curve_train_sizes: Optional[List[int]]=None) -> None:
        """クロスバリデーションでの学習・評価を行う
        学習・評価とともに、各foldのモデルの保存、スコアのログ出力についても行う
        """
        logger.info(f'{self.run_name} - start training cv')

        scores = []
        va_idxes = []
        preds = []

        lr_curve = not (lr_curve_train_sizes is None)

        if lr_curve:
            train_scores = np.empty(( 0, len(lr_curve_train_sizes) ) , float)
            valid_scores = np.empty(( 0, len(lr_curve_train_sizes) ) , float)
        # 各foldで学習を行う
        for i_fold in range(self.n_fold):
            # 学習を行う
            logger.info(f'{self.run_name} fold {i_fold} - start training')
            if lr_curve:
                model, va_idx, va_pred, score, tr_score, val_score  = self.train_fold_lr(i_fold, lr_curve_train_sizes)
                train_scores = np.append(train_scores, tr_score.reshape(1, len(lr_curve_train_sizes)) ,axis=0)
                valid_scores = np.append(valid_scores, val_score.reshape(1, len(lr_curve_train_sizes)),axis=0)
            else:
                model, va_idx, va_pred, score = self.train_fold(i_fold)
            logger.info(f'{self.run_name} fold {i_fold} - end training - score {score}')

            # モデルを保存する
            model.save_model(self.features)

            # 結果を保持する
            va_idxes.append(va_idx)
            scores.append(score)
            preds.append(va_pred)

        # 各foldの結果をまとめる
        va_idxes = np.concatenate(va_idxes)
        order = np.argsort(va_idxes)
        preds = np.concatenate(preds, axis=0)
        preds = preds[order]

        logger.info(f'{self.run_name} - end training cv - score {np.mean(scores)}')

        # 予測結果の保存
        Util.dump(preds, f'../model/pred/{self.features}/{self.run_name}-train.pkl')

        # 評価結果の保存
        logger.result_scores(self.run_name, scores)
        if lr_curve:
            self._plot_lr_curve(lr_curve_train_sizes, train_scores, valid_scores)
    def run_predict_all(self) -> None:
        """学習データすべてで学習したモデルにより、テストデータの予測を行う
        あらかじめrun_train_allを実行しておく必要がある
        """
        logger.info(f'{self.run_name} - start prediction all')

        test_x = RunnerLeaveOneOut.load_x_test(self.features)

        # 学習データ全てで学習したモデルで予測を行う
        i_fold = 'all'
        model = self.build_model(i_fold)
        model.load_model(self.features)
        pred = model.predict(test_x)

        # 予測結果の保存
        Util.dump(pred, f'../model/pred/{self.run_name}-test.pkl')

        logger.info(f'{self.run_name} - end prediction all')
Exemple #5
0
 def save_model(self, feature):
     model_path = os.path.join(f'../model/model/{feature}',
                               f'{self.run_fold_name}.model')
     os.makedirs(os.path.dirname(model_path), exist_ok=True)
     Util.dump(self.model, model_path)