Esempi in Python per PhyloBuddy.root

Esempio n. 1

File: phylobuddy_test.py Progetto: JamesL13/BuddySuite

def test_root_mrca(phylobuddy, next_hash):
    tester = Pb.root(phylobuddy, "ovi47[ab]", "penIT11b")
    assert phylo_to_hash(tester) == next_hash

Esempio n. 2

File: phylobuddy_test.py Progetto: JamesL13/BuddySuite

def test_root_middle(phylobuddy, next_hash):
    tester = Pb.root(phylobuddy)
    assert phylo_to_hash(tester) == next_hash

Esempio n. 3

File: phylobuddy_test.py Progetto: JamesL13/BuddySuite

def test_root_leaf(phylobuddy, next_hash):
    tester = Pb.root(phylobuddy, "firSA25a")
    assert phylo_to_hash(tester) == next_hash

Esempio n. 4

File: phylobuddy_test.py Progetto: xtmgah/BuddySuite

def test_root_mrca(phylobuddy, next_hash):
    tester = Pb.root(phylobuddy, ["firSA25a", "penSH31b"])
    assert phylo_to_hash(tester) == next_hash