Esempi in Python per as_dendropy_object

Esempio n. 1

File: test_ete.py Progetto: BioinformaticsArchive/DendroPy

 def testTreeListRoundTrip(self):
     ete_t = ete.as_ete_object(self.trees)
     rt = ete.as_dendropy_object(ete_t, taxon_set=self.trees.taxon_set)
     self.assertTrue(isinstance(rt, dendropy.TreeList), type(rt))
     self.assertDistinctButEqual(self.trees, rt, distinct_taxa=False)

Esempio n. 2

File: test_ete.py Progetto: emilhaegglund/wgfast

 def testTreeListRoundTrip(self):
     ete_t = ete.as_ete_object(self.trees)
     rt = ete.as_dendropy_object(ete_t, taxon_set=self.trees.taxon_set)
     self.assertTrue(isinstance(rt, dendropy.TreeList), type(rt))
     self.assertDistinctButEqual(self.trees, rt, distinct_taxa=False)

Esempio n. 3

File: test_ete.py Progetto: BioinformaticsArchive/DendroPy

 def testTreeRoundTrip(self):
     t1 = self.trees[0]
     ete_t = ete.as_ete_object(t1)
     rt = ete.as_dendropy_object(ete_t, taxon_set=t1.taxon_set)
     self.assertTrue(isinstance(rt, dendropy.Tree), type(rt))
     self.assertDistinctButEqual(t1, rt, distinct_taxa=False)

Esempio n. 4

File: test_ete.py Progetto: emilhaegglund/wgfast

 def testTreeRoundTrip(self):
     t1 = self.trees[0]
     ete_t = ete.as_ete_object(t1)
     rt = ete.as_dendropy_object(ete_t, taxon_set=t1.taxon_set)
     self.assertTrue(isinstance(rt, dendropy.Tree), type(rt))
     self.assertDistinctButEqual(t1, rt, distinct_taxa=False)