Esempi in Python per remove_overhangs

Esempio n. 1

 def test_does_not_remove_unclosed_overhang(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs('(atg/aa'), '(atg/aa')
     self.assertEquals(remove_overhangs('atg/aa)'), 'atg/aa)')

Esempio n. 2

 def test_works_with_single_char_input(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs(')'), ')')
     self.assertEquals(remove_overhangs('('), '(')

Esempio n. 3

 def test_removes_front_and_back(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs('(atg/)aa(atg/)'), 'aa')

Esempio n. 4

 def test_does_not_remove_internal_overhang(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs('(atg/)a(atg/)a(atg/)'), 'a(atg/)a')

Esempio n. 5

File: test_recombine.py Progetto: Chris7/edge

 def test_works_with_single_char_input(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs(')'), ')')
     self.assertEquals(remove_overhangs('('), '(')

Esempio n. 6

 def test_removes_back_overhang(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs('aa(atg/)'), 'aa')

Esempio n. 7

File: test_recombine.py Progetto: Chris7/edge

 def test_does_not_remove_internal_overhang(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs('(atg/)a(atg/)a(atg/)'), 'a(atg/)a')

Esempio n. 8

File: test_recombine.py Progetto: Chris7/edge

 def test_does_not_remove_unclosed_overhang(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs('(atg/aa'), '(atg/aa')
     self.assertEquals(remove_overhangs('atg/aa)'), 'atg/aa)')

Esempio n. 9

File: test_recombine.py Progetto: Chris7/edge

 def test_removes_back_overhang(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs('aa(atg/)'), 'aa')

Esempio n. 10

File: test_recombine.py Progetto: Chris7/edge

 def test_removes_front_and_back(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs('(atg/)aa(atg/)'), 'aa')

Esempio n. 11

 def test_works_with_single_char_input(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs(")"), ")")
     self.assertEquals(remove_overhangs("("), "(")

Esempio n. 12

 def test_does_not_remove_unclosed_overhang(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs("(atg/aa"), "(atg/aa")
     self.assertEquals(remove_overhangs("atg/aa)"), "atg/aa)")

Esempio n. 13

 def test_does_not_remove_internal_overhang(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs("(atg/)a(atg/)a(atg/)"), "a(atg/)a")

Esempio n. 14

 def test_removes_front_and_back(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs("(atg/)aa(atg/)"), "aa")

Esempio n. 15

 def test_removes_back_overhang(self):
     self.assertEquals(remove_overhangs("aa(atg/)"), "aa")