def readdata(f1, mce_file1, mce, head1, n, a, filestarttime, rc, ch, row): h1 = f1.Read(row_col=True, unfilter='DC').data #h2 = f2.Read(row_col=True, unfilter='DC').data d1 = np.empty([h1.shape[0], h1.shape[1]], dtype=float) for b in range(h1.shape[0]): for c in range(h1.shape[1]): d1[b][c] = (np.std(h1[b][c][:], dtype=float)) # d2 = np.empty([h2.shape[0],h2.shape[1]],dtype=float) # for b in range(h1.shape[0]): # for c in range(h1.shape[1]): # d2[b][c] = (np.std(h2[b][c][:],dtype=float)) g1 = h1[:, ch - 1] # + ((rc-1) * 8) - 1] #g2 = h2[:,ch - 1] array1 = [] for j in range(g1.shape[1]): array1.append(g1[row - 1][j]) #array2.append(g2[row - 1][j]) graphdata1 = [a, ch, array1] #graphdata2 = [a,ch,array2] subprocess.Popen(['rm %s' % (mce_file1)], shell=True) #subprocess.Popen(['rm %s' % (mce_file2)], shell=True) netcdfdir = '/home/pilot1/Desktop/time-data/netcdffiles' if n == 0: filestarttime = dt.datetime.utcnow() filestarttime = filestarttime.isoformat() print(colored('------------ New File -------------', 'green')) #mce = nc.new_file(h1.shape, head1, head2, filestarttime) mce = nc.new_file(h1.shape, head1, filestarttime) if rc == 's': #nc.data_all(h1,h2,n,head1,head2,filestarttime) nc.data_all(h1, n, head1, filestarttime) else: #nc.data(h1,h2,n,head1,head2,filestarttime) nc.data(h1, n, head1, filestarttime) elif os.stat(netcdfdir + "/raw_%s.nc" % (filestarttime)).st_size >= 20 * 10**6: n = 0 print(colored('----------- New File ------------', 'green')) filestarttime = datetime.datetime.utcnow() filestarttime = filestarttime.isoformat() #mce = nc.new_file(h1.shape, head1, head2, filestarttime) mce = nc.new_file(h1.shape, head1, filestarttime) if rc == 's': #nc.data_all(h1,h2,n,head1,head2,filestarttime) nc.data_all(h1, n, head1, filestarttime) else: #nc.data(h1,h2,n,head1,head2,filestarttime) nc.data(h1, n, head1, filestarttime) else: if rc == 's': #nc.data_all(h1,h2,n,head1,head2,filestarttime) nc.data_all(h1, n, head1, filestarttime) else: #nc.data(h1,h2,n,head1,head2,filestarttime) nc.data(h1, n, head1, filestarttime) n = n + 1 #return mce, n, filestarttime, d1, d2, graphdata1, graphdata2 return mce, n, filestarttime, d1, graphdata1
def readdataall(f,mce_file_name): h = f.Read(row_col=True, unfilter='DC').data st.h_size = h.shape[2] #d = np.array([[ [] for i in range(8)] for j in range(41)]) d = np.empty([h.shape[0],h.shape[1]],dtype=float) for b in range(h.shape[0]): for c in range(h.shape[1]): d[b][c] = (np.std(h[b][c],dtype=float)) #ADDING DATA TO NETCDF/CHECK FOR NETCDF FILE SIZE-------------------------------------------------------------------------------------------- if os.stat("~/gui_data_test{n}.nc".format(n=st.n)).st_size < 5*10**6 : # of bytes here nc.data(h,d,;st.n,st.a) else: st.n = st.n + 1 nc.mce.close() nc.new_file(st.n) nc.data(h,d,st.n,st.a) #---------------------------------------------------------------------------------------------- z = ([[d[0][0], d[0][1], d[0][2], d[0][3], d[0][4], d[0][5], d[0][6],\ d[0][7], d[0][8], d[0][9], d[0][10], d[0][11], d[0][12], d[0][13],\ d[0][14], d[0][15], d[0][16], d[0][17], d[0][18], d[0][19],\ d[0][20], d[0][21], d[0][22], d[0][22], d[0][24], d[0][25],\ d[0][26], d[0][27], d[0][28], d[0][29], d[0][30], d[0][31]],\ [d[1][0], d[1][1], d[1][2], d[1][3], d[1][4], d[1][5], d[1][6],\ d[1][7], d[1][8], d[1][9], d[1][10], d[1][11], d[1][12], d[1][13],\ d[1][14], d[1][15], d[1][16], d[1][17], d[1][18], d[1][19],\ d[1][20], d[1][21], d[1][22], d[1][23], d[1][24], d[1][25],\ d[1][26], d[1][27], d[1][28], d[1][29], d[1][33], d[1][31]],\ [d[2][0], d[2][1], d[2][2], d[2][3], d[2][4], d[2][5], d[2][6],\ d[2][7], d[2][8], d[2][9], d[2][10], d[2][11], d[2][12], d[2][13],\ d[2][14], d[2][15], d[2][16], d[2][17], d[2][18], d[2][19],\ d[2][20], d[2][21], d[2][22], d[2][23], d[2][24], d[2][25],\ d[2][26], d[2][27], d[2][28], d[2][29], d[2][33], d[2][31]],\ [d[3][0], d[3][1], d[3][2], d[3][3], d[3][4], d[3][5], d[3][6],\ d[3][7], d[3][8], d[3][9], d[3][10], d[3][11], d[3][12], d[3][13],\ d[3][14], d[3][15], d[3][16], d[3][17], d[3][18], d[3][19],\ d[3][20], d[3][21], d[3][22], d[3][23], d[3][24], d[3][25],\ d[3][26], d[3][27], d[3][28], d[3][29], d[3][33], 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d[15][30], d[15][31]],\ [d[16][0], d[16][1], d[16][2], d[16][3], d[16][4], d[16][5],\ d[16][6], d[16][7], d[16][8], d[16][9], d[16][10], d[16][11],\ d[16][12], d[16][13], d[16][14], d[16][15], d[16][16], d[16][17],\ d[16][18], d[16][19], d[16][20], d[16][21], d[16][22], d[16][23],\ d[16][24], d[16][25], d[16][26], d[16][27], d[16][28], d[16][29],\ d[16][30], d[16][31]],\ [d[17][0], d[17][1], d[17][2], d[17][3], d[17][4], d[17][5],\ d[17][6], d[17][7], d[17][8], d[17][9], d[17][10], d[17][11],\ d[17][12], d[17][13], d[17][14], d[17][15], d[17][16], d[17][17],\ d[17][18], d[17][19], d[17][20], d[17][21], d[17][22], d[17][23],\ d[17][24], d[17][25], d[17][26], d[17][27], d[17][28], d[17][29],\ d[17][30], d[17][31]],\ [d[18][0], d[18][1], d[18][2], d[18][3], d[18][4], d[18][5],\ d[18][6], d[18][7], d[18][8], d[18][9], d[18][10], d[18][11],\ d[18][12], d[18][13], d[18][14], d[18][15], d[18][16], d[18][17],\ d[18][18], d[18][19], d[18][20], d[18][21], d[18][22], d[18][23],\ d[18][24], 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def readdata(f, mce_file_name): h = f.Read(row_col=True, unfilter='DC').data st.h_size = h.shape[2] #delete_file = ["rm %s" %(mce_file_name)] #to keep temp files from piling up in memory #subprocess.Popen(delete_file,shell=True) #d = np.array([[ [] for i in range(8)] for j in range(41)]) d = np.empty([h.shape[0], h.shape[1]], dtype=float) for b in range(h.shape[0] - 1): for c in range(h.shape[1] - 1): d[b][c] = (np.std(h[b][c], dtype=float)) #ADDING DATA TO NETCDF/CHECK FOR CETCDF FILE SIZE-------------------------------------------------------------------------------------------- if os.stat("~/gui_data_test{n}.nc".format( n=st.n)).st_size < 5 * 10**6: # of bytes here nc.data(h, d, st.n, st.a) else: st.n = st.n + 1 nc.mce.close() nc.new_file(st.n) nc.data(h, d, st.n, st.a) #---------------------------------------------------------------------------------------------- z = ([[ d[0][0], d[0][1], d[0][2], d[0][3], d[0][4], d[0][5], d[0][6], d[0][7] ], [ d[1][0], d[1][1], d[1][2], d[1][3], d[1][4], d[1][5], d[1][6], d[1][7] ], [ d[2][0], d[2][1], d[2][2], d[2][3], d[2][4], d[2][5], d[2][6], d[2][7] ], [ d[3][0], d[3][1], d[3][2], d[3][3], d[3][4], d[3][5], d[3][6], d[3][7] ], [ d[4][0], d[4][1], d[4][2], d[4][3], d[4][4], d[4][5], d[4][6], d[4][7] ], [ d[5][0], d[5][1], d[5][2], d[5][3], d[5][4], d[5][5], d[5][6], d[5][7] ], [ d[6][0], d[6][1], d[6][2], d[6][3], d[6][4], d[6][5], d[6][6], d[6][7] ], [ d[7][0], d[7][1], d[7][2], d[7][3], d[7][4], d[7][5], d[7][6], d[7][7] ], [ d[8][0], d[8][1], d[8][2], d[8][3], d[8][4], d[8][5], d[8][6], d[8][7] ], [ d[9][0], d[9][1], d[9][2], d[9][3], d[9][4], d[9][5], d[9][6], d[9][7] ], [ d[10][0], d[10][1], d[10][2], d[10][3], d[10][4], d[10][5], d[10][6], d[10][7] ], [ d[11][0], d[11][1], d[11][2], d[11][3], d[11][4], d[11][5], d[11][6], d[11][7] ], [ d[12][0], d[12][1], d[12][2], d[12][3], d[12][4], d[12][5], d[12][6], d[12][7] ], [ d[13][0], d[13][1], d[13][2], d[13][3], d[13][4], d[13][5], d[13][6], d[13][7] ], [ d[14][0], d[14][1], d[14][2], d[14][3], d[14][4], d[14][5], d[14][6], d[14][7] ], [ d[15][0], d[15][1], d[15][2], d[15][3], d[15][4], d[15][5], d[15][6], d[15][7] ], [ d[16][0], d[16][1], d[16][2], d[16][3], d[16][4], d[16][5], d[16][6], d[16][7] ], [ d[17][0], d[17][1], d[17][2], d[17][3], d[17][4], d[17][5], d[17][6], d[17][7] ], [ d[18][0], d[18][1], d[18][2], d[18][3], d[18][4], d[18][5], d[18][6], d[18][7] ], [ d[19][0], d[19][1], d[19][2], d[19][3], d[19][4], d[19][5], d[19][6], d[19][7] ], [ d[23][0], d[23][1], d[23][2], d[23][3], d[23][4], d[23][5], d[23][6], d[23][7] ], [ d[21][0], d[21][1], d[21][2], d[21][3], d[21][4], d[21][5], d[21][6], d[21][7] ], [ d[22][0], d[22][1], d[22][2], d[22][3], d[22][4], d[22][5], d[22][6], d[22][7] ], [ d[23][0], d[23][1], d[23][2], d[23][3], d[23][4], d[23][5], d[23][6], d[23][7] ], [ d[24][0], d[24][1], d[24][2], d[24][3], d[24][4], d[24][5], d[24][6], d[24][7] ], [ d[25][0], d[25][1], d[25][2], d[25][3], d[25][4], d[25][5], d[25][6], d[25][7] ], [ d[26][0], d[26][1], d[26][2], d[26][3], d[26][4], d[26][5], d[26][6], d[26][7] ], [ d[27][0], d[27][1], d[27][2], d[27][3], d[27][4], d[27][5], d[27][6], d[27][7] ], [ d[28][0], d[28][1], d[28][2], d[28][3], d[28][4], d[28][5], d[28][6], d[28][7] ], [ d[29][0], d[29][1], d[29][2], d[29][3], d[29][4], d[29][5], d[29][6], d[29][7] ], [ d[30][0], d[30][1], d[30][2], d[30][3], d[30][4], d[30][5], d[30][6], d[30][7] ], [ d[31][0], d[31][1], d[31][2], d[31][3], d[31][4], d[31][5], d[31][6], d[31][7] ]]) filename = 'tempfiles/tempzdata.txt' tempfile = open(filename, 'w') for x in range(h.shape[0] - 1): for y in range(h.shape[1] - 1): tempfile.write(str(z[x][y]) + ' ') tempfile.write('\n') tempfile.close()
tempfile = open(filename, 'a') for j in range(d.shape[0]*d.shape[1]-1): tempfile.write(str(y[len(y)-1][j])+' ') tempfile.close() return y def read_header(f): for key,value in f.header.items(): if key == '_rc_present': for i in range(len(value)): if value[i] == True: value[i] = "1" elif value[i] == False: value[i] = "0" else: print("I don't know what I am...") value = ''.join(map(str,value)) value = str(value) st.keys.append(key) st.values.append(value) # keys,values = zip(*f.header.items()) st.keys = np.asarray(st.keys,dtype=object) st.values = np.asarray(st.values,dtype=object) st.head = np.array((st.keys,st.values)).T if __name__ =="__main__": st.init() takedataall(sys.argv[1]) nc.new_file(n)
elif ch == 8: tempfile.write(str(y[i]) + ' ' + 'pink' + '\n') #tempfile.write(str(y[0])) tempfile.close() def read_header(f): for key, value in f.header.items(): if key == '_rc_present': for i in range(len(value)): if value[i] == True: value[i] = "1" elif value[i] == False: value[i] = "0" else: print("I don't know what I am...") value = ''.join(map(str, value)) value = str(value) st.keys.append(key) st.values.append(value) # keys,values = zip(*f.header.items()) st.keys = np.asarray(st.keys, dtype=object) st.values = np.asarray(st.values, dtype=object) st.head = np.array((st.keys, st.values)).T if __name__ == "__main__": st.init() takedata(sys.argv[1]) nc.new_file(st.n)