Esempi in Python per get_gene_list

Esempio n. 1

 def test_get_gene_list_nested_and_or(self):
     genes = '(gene_a or gene_d) or (gene_b and gene_c)'
     self.assertEqual(psammotate.get_gene_list(genes),
                      frozenset(['gene_a', 'gene_b', 'gene_c', 'gene_d']))

Esempio n. 2

 def test_get_gene_list_multiple_nests(self):
     genes = '(gene_a or (gene_b and gene_c)) or gene_d'
     self.assertEqual(psammotate.get_gene_list(genes),
                      frozenset(['gene_a', 'gene_b', 'gene_c', 'gene_d']))

Esempio n. 3

 def test_get_gene_list_or(self):
     genes = 'gene_a or gene_b'
     self.assertEqual(psammotate.get_gene_list(genes),
                      frozenset(['gene_a', 'gene_b']))